Patterns of defence gene expression in the tomato–<i>Verticillium</i>interaction
Notice bibliographique
Résumé
In a tomato plant infected by Verticillium dahliae , race 1, compatibility or incompatibility appears to be determined in the stem, but little is known about the genes that either regulate or effect critical cellular events. In the present study, microarray and RT-PCR analyses were used to assess changes in tomato mRNA populations during both interactions. Initially, a commercially available DNA chip was used to screen gene expression at a single critical time point after inoculation of resistant and susceptible plants. From the results, the most-affected genes were selected to develop a tomato Verticillium response (TVR) DNA chip for detailed analyses of gene expression for 15 d after inoculation. Taken together, over half of the genes on the TVR array exhibited one of three distinct patterns of change, one reflecting a resistant phenotype and two being consistent with a susceptible phenotype. Of particular interest was a cluster of strongly expressed genes belonging to groups 2 and 3 that appeared to be co-ordinately down regulated in infected resistant plants relative to susceptible. Many of these genes encode pathogenesis related (PR) proteins. The data demonstrate that even though complex, the biological system can be standardized sufficiently to allow the reproducible analysis of gene expression in a whole plant system and provide patterns of transcriptional variation that can be used to assess the significance of specific genes in pathogenesis and resistance.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».