Identification of Differentially Expressed Genes in Brassinosteroid-Treated Brassica napus Seedlings
Notice bibliographique
Résumé
Brassinosteroid-mediated gene expression changes have been reported primarily in Arabidopsis thaliana but not in its close relative Brassica napus . To obtain an initial idea of the molecular changes induced by long-term exposure to 24-epibrassinolide (EBR) in B. napus seedlings, we used the differential display–reverse transcription PCR technique. Six differentially expressed cDNAs were isolated and characterized. These encode a mitochondrial transcription termination factor (mTERF)-related protein, glycine-rich protein 22 (GRP22), myrosinase, 3-ketoacyl-CoA thiolase, and a copia-like polyprotein. The first four were upregulated in EBR-treated seedlings while the latter was expressed at higher levels in untreated seedlings. Transcripts of mTERF-related protein, GRP22, and myrosinase were present at higher levels in treated seedlings under nonstress conditions, whereas those of 3-ketoacyl-CoA thiolase rose to higher levels in treated seedlings during exposure to heat stress. The results of the present study indicate that EBR treatment in B. napus leads to substantial changes in the expression levels of genes involved in a variety of physiologic responses. The results provide a useful framework for further research into EBR-mediated molecular changes in B. napus , which will also add to our understanding of how brassinosteroids mediate stress tolerance in this agriculturally important oil crop.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».