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Enregistrement W2053617289 · doi:10.1007/s00344-008-9056-5

Identification of Differentially Expressed Genes in Brassinosteroid-Treated Brassica napus Seedlings

2008· article· en· W2053617289 sur OpenAlexafffund
Sangeeta Dhaubhadel, Priti Krishna

Notice bibliographique

RevueJournal of Plant Growth Regulation · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Stress Responses and Tolerance
Établissements canadiensWestern University
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésBrassinosteroidBiologyBrassicaThiolaseSiliqueGeneArabidopsis thalianaArabidopsisGeneticsPlant physiologyTranscription factorGene expressionBotanyBiochemistryPeroxisomeMutant

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Brassinosteroid-mediated gene expression changes have been reported primarily in Arabidopsis thaliana but not in its close relative Brassica napus . To obtain an initial idea of the molecular changes induced by long-term exposure to 24-epibrassinolide (EBR) in B. napus seedlings, we used the differential display–reverse transcription PCR technique. Six differentially expressed cDNAs were isolated and characterized. These encode a mitochondrial transcription termination factor (mTERF)-related protein, glycine-rich protein 22 (GRP22), myrosinase, 3-ketoacyl-CoA thiolase, and a copia-like polyprotein. The first four were upregulated in EBR-treated seedlings while the latter was expressed at higher levels in untreated seedlings. Transcripts of mTERF-related protein, GRP22, and myrosinase were present at higher levels in treated seedlings under nonstress conditions, whereas those of 3-ketoacyl-CoA thiolase rose to higher levels in treated seedlings during exposure to heat stress. The results of the present study indicate that EBR treatment in B. napus leads to substantial changes in the expression levels of genes involved in a variety of physiologic responses. The results provide a useful framework for further research into EBR-mediated molecular changes in B. napus , which will also add to our understanding of how brassinosteroids mediate stress tolerance in this agriculturally important oil crop.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,205
Écart entre enseignants0,188 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations23
Publié2008
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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