MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2053660315 · doi:10.1111/j.1751-1097.2010.00775.x

Design and Characterization of an Aequorin‐based Bacterial Biosensor for Detection of Toluene and Related Compounds

2010· article· en· W2053660315 sur OpenAlexfundno aff
Mehdi Zeinoddini, Khosro Khajeh, Farida Behzadian, Saman Hosseinkhani, Alireza Saeedinia, Hesam Barjesteh

Notice bibliographique

RevuePhotochemistry and Photobiology · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
Thématiquebioluminescence and chemiluminescence research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesMerck Canada
Mots-clésAequorinBioreporterBioluminescenceBiosensorActivator (genetics)Molecular biologyOperonChemistrylac operonPromoterEscherichia coliBiologyBiochemistryReporter geneGene expressionReceptorGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

An aequorin-based Escherichia coli strain JM109 biosensor was constructed and characterized for its potential to detect toluene and related compounds in aqueous solutions. The biosensor was constructed based on a PGL2 plasmid carrying the lower pathway promoter (Pu) of the xyl operon of Pseudomonas putida mt-2, which was incorporated with transcriptional activator xylR and fused to aequorin cDNA named pGL2-aequorin. Binding of xylR protein to a subset of toluene-like compounds activates transcription at the Pu promoter, thus expression of aequorin is controlled by xylR and Pu. In this work we have compared the effect of Shine-Dalgarno (SD) and T2 rrnβ terminator sequence in the expression of aequorin. According to the sensitivity of aequorin and increase in the signal-to-noise ratio, this reporter enzyme has reasonable sensitivity compared with other reporter systems. The results indicate higher expression of aequorin in the presence of SD and T2 rrnβ. The activity of aequorin in recombinant whole-cell biosensor was linear from 1 to 500 μm of toluene. The bioluminescence response was specific for toluene-like molecules, so this biosensor cells would be able to detect toluene derivative contamination in environmental samples, accurately.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,511

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,256
Écart entre enseignants0,244 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations17
Publié2010
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revuePhotochemistry and PhotobiologyMême sujetbioluminescence and chemiluminescence researchTravaux en français237 207