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Enregistrement W2053714100 · doi:10.1074/jbc.m006082200

Mapping of the ATP-binding Sites on Inositol 1,4,5-Trisphosphate Receptor Type 1 and Type 3 Homotetramers by Controlled Proteolysis and Photoaffinity Labeling

2001· article· en· W2053714100 sur OpenAlexfundno aff
Karlien Maes, Ludwig Missiaen, Jan B. Parys, Patrick De Smet, Ilse Sienaert, Etienne Waelkens, Geert Callewaert, Humbert De Smedt

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2001
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueProtein Kinase Regulation and GTPase Signaling
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesVlaamse regeringFonds Wetenschappelijk OnderzoekUniversité de SherbrookeThomas Jefferson University
Mots-clésProteolysisPhotoaffinity labelingInositolChemistryBiochemistryReceptorBinding siteStereochemistryEnzyme

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Submillimolar ATP concentrations strongly enhance the inositol 1,4,5-trisphosphate (IP(3))-induced Ca(2+) release, by binding specifically to ATP-binding sites on the IP(3) receptor (IP(3)R). To locate those ATP-binding sites on IP(3)R1 and IP(3)R3, both proteins were expressed in Sf9 insect cells and covalently labeled with 8-azido-[alpha-(32)P]ATP. IP(3)R1 and IP(3)R3 were then purified and subjected to a controlled proteolysis, and the labeled proteolytic fragments were identified by site-specific antibodies. Two fragments of IP(3)R1 were labeled, each containing one of the previously proposed ATP-binding sites with amino acid sequence GXGXXG (amino acids 1773-1780 and 2016-2021, respectively). In IP(3)R3, only one fragment was labeled. This fragment contained the GXGXXG sequence (amino acids 1920-1925), which is conserved in the three IP(3)R isoforms. The presence of multiple interaction sites for ATP was also evident from the IP(3)-induced Ca(2+) release in permeabilized A7r5 cells, which depended on ATP over a very broad concentration range from micromolar to millimolar.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,009
Score d'incertitude au seuil0,314

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,243
Écart entre enseignants0,226 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations50
Publié2001
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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