PHYLOGENETIC RELATIONSHIPS AMONG STREPTOPHYTES AS INFERRED FROM CHLOROPLAST SMALL AND LARGE SUBUNIT rRNA GENE SEQUENCES<sup>1</sup>
Notice bibliographique
Résumé
To gain insights into the phylogeny of charophytes and into their relationships with other green algae and bryophytes, we analyzed the chloroplast small and large subunit rRNA sequences of charophytes belonging to five orders (Charales, Coleochaetales, Desmidiales, Klebsormidiales, and Zygnematales), of chlorophytes from the four remaining classes of green algae, and of bryophytes representing the three classes reported in this group of land plants. We also probed the gene organization and intron content of the chloroplast rDNA operon in charophytes and bryophytes. The organization of this operon proved to be highly conserved, except in members of the Desmidiales and Zygnematales. Homologous group II introns were identified in the trnA (UGC) gene of all charophyte groups examined and in the trnI (GAU) gene of charophytes from all orders except the Desmidiales and Zygnematales. Phylogenetic analyses of concatenated rDNA sequences consistently placed the prasinophyte Mesostigma viride Lauterborn at the base of the Streptophyta and Chlorophyta, although alternative topologies positioning Mesostigma within the Streptophyta could not be rejected. A sister group relationship was unambiguously established between Chaetosphaeridium globosum (Nordstedt) Klebahn and members of the Coleochaetales. The Charales, Coleochaetales, Desmidiales, and Zygnematales were found to be monophyletic, and a sister group relationship was observed for the Desmidiales and Zygnematales. Although our analyses failed to resolve the branching order of the Coleochaetales, Charales, Desmidiales/Zygnematales, and bryophytes, they revealed that the problematic charophyte taxon Entransia fimbriata Hughes strongly clusters with Klebsormidium flaccidum (Kützing) Silva, Mattox et Blackwell to form a basal lineage relative to the other charophyte orders examined.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,011 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».