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Enregistrement W2053941125 · doi:10.1074/jbc.m109.033670

pH-dependent Internalization of Muramyl Peptides from Early Endosomes Enables Nod1 and Nod2 Signaling

2009· article· en· W2053941125 sur OpenAlexaff
Jooeun Lee, Ivan Tattoli, Kacper A. Wojtal, Stephan R. Vavricka, Dana J. Philpott, Stephen E. Girardin

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueImmune Response and Inflammation
Établissements canadiensUniversity of TorontoCanada Research Chairs
Organismes subventionnairesSchweizerischer Nationalfonds zur Förderung der Wissenschaftlichen Forschung
Mots-clésInternalizationEndosomeNOD1EndocytosisCell biologyNOD2PeptidoglycanEndocytic cycleCytosolBiologySignal transductionMuramyl dipeptideChemistryBiochemistryIntracellularReceptorInnate immune systemEnzyme

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Nod1 and Nod2 are members of the Nod-like receptor family that detect intracellular bacterial peptidoglycan-derived muramyl peptides. The biological effects of muramyl peptides have been described for over three decades, but the mechanism underlying their internalization to the cytosol remains unclear. Using the human epithelial cell line HEK293T as a model system, we demonstrate here that Nod1-activating ligands entered cells through endocytosis, most likely by the clathrin-coated pit pathway, as internalization was dynamin-dependent but not inhibited by methyl-beta-cyclodextrin. In the endocytic pathway, the cytosolic internalization of Nod1 ligands was pH-dependent, occurred prior to the acidification mediated by the vacuolar ATPase, and was optimal at pH ranging from 5.5 to 6. Similarly, the Nod2 ligand MDP was internalized into host cytosol through a similar pathway with optimal pH for internalization ranging from 5.5 to 6.5. Moreover, Nod1-activating muramyl peptides likely required processing by endosomal enzymes, prior to transport into the cytosol, suggesting the existence of a sterically gated endosomal transporter for Nod1 ligands. In support for this, we identified a role for SLC15A4, an oligopeptide transporter expressed in early endosomes, in Nod1-dependent NF-kappaB signaling. Interestingly, SLC15A4 expression was also up-regulated in colonic biopsies from patients with inflammatory bowel disease, a disorder associated with mutations in Nod1 and Nod2. Together, our results shed light on the mechanisms by which muramyl peptides get access to the host cytosol, where they are detected by Nod1 and Nod2, and might have implications for the understanding of human diseases, such as inflammatory bowel disease.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,317

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,223
Écart entre enseignants0,211 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations211
Publié2009
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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