The origin and spread of eukaryotic photosynthesis: evolving views in light of genomics
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Plants and algae acquired photosynthesis through the assimilation of a prokaryotic endosymbiont related to the ancestors of modern-day cyanobacteria. This landmark event, known as the primary endosymbiotic origin of plastids, is generally thought to have occurred only once during the history of eukaryotes and to have given rise to the plastids of green algae, land plants, red algae and glaucophyte algae through vertical evolution. Plastids have also spread horizontally across the tree of eukaryotes by “secondary” endosymbioses involving heterotrophic host eukaryotes and both green and red algal endosymbionts. Here I provide an overview of current research in the area of plastid evolution, focusing on the latest advances in the field of algal comparative genomics. Recent genome-scale analyses of both photosynthetic and non-photosynthetic eukaryotes have provided fresh new insight into the pattern and process of secondary endosymbiosis, although it is still not possible to discern with confidence the number of endosymbiotic events that gave rise to the known spectrum of eukaryotic phototrophs. In fact, with more genomic data has come the intriguing possibility that the nuclear genomes of some secondary plastid-containing algae are a mosaic of genes derived from multiple endosymbioses, adding yet another layer of complexity to the convoluted evolutionary history of these fascinating organisms.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,004 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,010 |
| Communication savante | 0,005 | 0,012 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,002 |
| Intégrité de la recherche | 0,002 | 0,004 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».