Characterization of the Regiochemistry and Cryptoregiochemistry of a <i>Caenorhabditis elegans</i> Fatty Acid Desaturase (<i>FAT-1</i>) Expressed in <i>Saccharomyces cerevisiae</i>
Notice bibliographique
Résumé
To characterize the fatty acid desaturase produced by the fat-1 gene from the nematode Caenorhabditis elegans, the functional expression of this enzyme was effected in the yeast Saccharomyces cerevisiae. The GC-MS analysis of desaturated products derived from various fatty acids, including deuterium-labeled thia fatty acids supplied to growing cultures of transformed yeast, has defined the substrate requirements, regiochemistry, and cryptoregiochemistry of the enzyme. The desaturase acts on substrates of 16-20 carbons with a preference for omega-6 fatty acids, and its regioselectivity was confirmed to be that of an omega-3 desaturase. (omega-x refers to a double bond or desaturation between carbons x and x+1, counting from the methyl end of a fatty acid.) The primary deuterium kinetic isotope effects (KIEs) at C-15 and C-16 of a C18 fatty acid analogue were measured via competitive incubation experiments: While k(H)/k(D) at the omega-3 position was shown to be large (7.8 +/- 0.4), essentially no KIE at the omega-2 position was observed (k(H)/k(D) = 0.99 +/- 0.04). This result indicates that omega-3 desaturation is initiated by an energetically difficult C-H bond cleavage at the carbon closer to the carboxyl terminus. The results are discussed in the context of a general model relating the structure and function of membrane-bound fatty acid desaturases featuring differing regioselectivities.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».