MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2054143423 · doi:10.1002/anie.201402750

A Series of Potent CREBBP Bromodomain Ligands Reveals an Induced‐Fit Pocket Stabilized by a Cation–π Interaction

2014· article· en· W2054143423 sur OpenAlex
Timothy P. C. Rooney, P. Filippakopoulos, O. Fedorov, S. Picaud, Wilian A. Cortopassi, Duncan A. Hay, Sarah Martin, Anthony Tumber, Catherine Rogers, Martin Philpott, Minghua Wang, Amber L. Thompson, Tom D. Heightman, David C. Pryde, Andrew S. Cook, Robert S. Paton, Susanne Müller, Stefan Knapp, Paul E. Brennan, Stuart J. Conway

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.
no affAucune affiliation canadienne : ce travail est invisible pour une base fondée sur la seule affiliation.
Aucune affiliation canadienne. Une base fondée sur la seule affiliation (le devis habituel) n'aurait jamais vu ce travail. C'est l'un des travaux qui justifient l'inversion de la base.

Notice bibliographique

RevueAngewandte Chemie International Edition · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueProtein Degradation and Inhibitors
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesCiência sem FronteirasMinistero dello Sviluppo EconomicoWellcome TrustOntario Ministry of Economic Development and InnovationEngineering and Physical Sciences Research CouncilCanadian Institutes of Health ResearchCoordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível SuperiorGenome CanadaPfizerEli Lilly and Company
Mots-clésBromodomainSeries (stratigraphy)ChemistryStereochemistryBiochemistryBiologyEpigenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The benzoxazinone and dihydroquinoxalinone fragments were employed as novel acetyl lysine mimics in the development of CREBBP bromodomain ligands. While the benzoxazinone series showed low affinity for the CREBBP bromodomain, expansion of the dihydroquinoxalinone series resulted in the first potent inhibitors of a bromodomain outside the BET family. Structural and computational studies reveal that an internal hydrogen bond stabilizes the protein-bound conformation of the dihydroquinoxalinone series. The side chain of this series binds in an induced-fit pocket forming a cation-π interaction with R1173 of CREBBP. The most potent compound inhibits binding of CREBBP to chromatin in U2OS cells.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,598

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,273
Écart entre enseignants0,257 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle