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Enregistrement W2054192566 · doi:10.1139/x03-094

Analysis of sex-linked, sequence-characterized amplified region markers in <i>Salix eriocephala</i>

2003· article· en· W2054192566 sur OpenAlexvenueno aff
Lee E. Gunter, Richard F. Kopp, Rachel Patton McCord, Gerald A. Tuskan

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Forest Research · 2003
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueBioenergy crop production and management
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesSyracuse University
Mots-clésBiologyLocus (genetics)WillowGeneticsGenetic markerSalix viminalisBotanyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Two DNA markers, sequence-characterized amplified region (SCAR) AE08780 and SCAR 354520, known to be linked to and flanking a putative sex determination locus in Salix viminalis L., were tested in another shrubform willow, Salix eriocephala Michx. Marker analysis of seven female and eight male S. eriocephala clones used to produce 34 fullsib families reveals that five pairs of parents are alternatively polymorphic relative to reciprocal male and female combinations for the two marker loci. A goodness-of-fit test of marker presence or absence and relationship to gender suggests that the occurrence of SCAR 354520 is not significantly different (χ2 = 3.18, df = 1, P > 0.05) from the expected ratio of marker presence:absence in the male and female progenies across all five families, indicating no relationship to gender. However, the occurrence of SCAR AE08780 differs significantly from expected (χ2 = 21.05, df = 1, P < 0.001) in the five families and seems to be linked to femaleness in S. eriocephala. Within a single family, 984 (n = 54), both markers show a significant deviation from expected at P < 0.01 (SCAR AE08780: χ2 = 11.37, df = 1; SCAR 354520: χ2 = 9.49, df = 1). These data support the hypothesis that there is an association between the markers and a locus associated with gender in two divergent species and that there may be a common sex determination mechanism in willow.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,090
Tête enseignante GPT0,296
Écart entre enseignants0,206 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations7
Publié2003
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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