Analysis of sex-linked, sequence-characterized amplified region markers in <i>Salix eriocephala</i>
Notice bibliographique
Résumé
Two DNA markers, sequence-characterized amplified region (SCAR) AE08780 and SCAR 354520, known to be linked to and flanking a putative sex determination locus in Salix viminalis L., were tested in another shrubform willow, Salix eriocephala Michx. Marker analysis of seven female and eight male S. eriocephala clones used to produce 34 fullsib families reveals that five pairs of parents are alternatively polymorphic relative to reciprocal male and female combinations for the two marker loci. A goodness-of-fit test of marker presence or absence and relationship to gender suggests that the occurrence of SCAR 354520 is not significantly different (χ2 = 3.18, df = 1, P > 0.05) from the expected ratio of marker presence:absence in the male and female progenies across all five families, indicating no relationship to gender. However, the occurrence of SCAR AE08780 differs significantly from expected (χ2 = 21.05, df = 1, P < 0.001) in the five families and seems to be linked to femaleness in S. eriocephala. Within a single family, 984 (n = 54), both markers show a significant deviation from expected at P < 0.01 (SCAR AE08780: χ2 = 11.37, df = 1; SCAR 354520: χ2 = 9.49, df = 1). These data support the hypothesis that there is an association between the markers and a locus associated with gender in two divergent species and that there may be a common sex determination mechanism in willow.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».