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Enregistrement W2055433038 · doi:10.1111/j.1744-7348.2008.00264.x

Transgenic expression of a viral EPS‐depolymerase is potentially useful to induce fire blight resistance in apple

2008· article· en· W2055433038 sur OpenAlexaff
Henryk Flachowsky, Klaus Richter, Whee-Soo Kim, Klaus Geider, Magda‐Viola Hanke

Notice bibliographique

RevueAnnals of Applied Biology · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Virus Research Studies
Établissements canadiensNorgen Biotek Corporation (Canada)
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyFire blightErwiniaTransformation (genetics)TransgeneAgrobacterium tumefaciensAgrobacteriumGenetically modified cropsMicrobiologyPlant disease resistanceGeneMarker geneBotanyMolecular biologyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Fire blight caused by Erwinia amylovora is the most destructive bacterial disease of pear and apple. The goal of this research was to improve fire blight resistance of apple by transformation with a gene encoding for an extracellular polysaccharide (EPS)‐depolymerase from the E. amylovora phage phi‐Ea1h. The EPS‐depolymerase gene (dpo) driven by the constitutive promoter CaMV35S was transferred into apple scion cv. ‘Pinova’ through Agrobacterium tumefaciens‐mediated leaf disk transformation using a binary vector and strains EHA105 or LBA4404. The integration of the dpo gene and the marker gene nptII was confirmed by polymerase chain reaction (PCR) and by Southern hybridisation. From 4560 leaves inoculated in 23 different transformation experiments, 33 independent shoots, regenerated from a single transformation event, were identified as transgenic. Nine of the shoots were randomly selected and vegetatively propagated to establish transgenic clones. The transgenic clones were diploid as was the non‐transgenic genotype ‘Pinova’ analysed by flow cytometry. Both transgenes (dpo and nptII) were transcriptionally active determined by reverse transcription (RT)‐PCR and quantitative RT‐PCR. EPS‐depolymerase was expressed in all transgenic clones showing substantial differences in its activity for different clones concerning EPS degradation. Resistance to E. amylovora was evaluated by infection of in vitro leaves as well as by artificial shoot inoculation of ex vitro plants in the greenhouse. No correlation was obtained for the transgenic lines between the level of dpo gene expression and both the level of depolymerase activity and the disease resistance in vitro, whereas, depolymerase activity did correlate positively with resistance to fire blight in vitro. Seven clones had less disease than the non‐transformed genotype when measured in greenhouse, but no statistically significant differences were found, except for line T373. One line showed the highest depolymerase activity and the least susceptibility to fire blight in vitro as well as in greenhouse (T187).

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,074
Tête enseignante GPT0,297
Écart entre enseignants0,223 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations28
Publié2008
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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