MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2055533114 · doi:10.3892/mmr.2013.1797

Inactive C8A-humanin analog is as stable as a potent S14G-humanin analog

2013· article· en· W2055533114 sur OpenAlexaff
Tsutomu Arakawa, Takako Niikura, Yoshiko Kita

Notice bibliographique

RevueMolecular Medicine Reports · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueGDF15 and Related Biomarkers
Établissements canadiensSimon Fraser University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCircular dichroismNeuroprotectionChemistryLigand (biochemistry)StereochemistryBiophysicsReceptorBiologyBiochemistryNeuroscience

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

We have previously shown that the structural stability of humanin (HN), a neuroprotective peptide ligand, is one of the attributes to the observed activity differences between HN analogs. It has been observed that the activity increased consecutively in the S7A‑HN analog, the parent HN and the S14G‑HN analog, consistent with the increased stability observed in that order. In the present study, the structure and stability of another inactive analog, C8A‑HN, was measured, which has been revealed to have no neuroprotective activity similar to that of the S7A‑HN analog and hence may have compromised stability. While all these analogs of HN demonstrated a similar disordered secondary structure in phosphate-buffered saline at 5˚C, as determined by circular dichroism spectroscopy, they revealed different structures at 37˚C. At 37˚C, less active HN and inactive S7A‑HN revealed a structure with a valley at ~217 nm, indicating a conversion from the disordered structure to a β‑sheet. Such a conversion was largely irreversible. By contrast, C8A‑HN and S14G‑HN demonstrated a similar structure at 37˚C and at 5˚C and remained largely disordered. The observed small structural changes of the C8A‑HN analog at 37˚C and its reversibility upon cooling do not support a hypothesis that the instability at 37˚C may have caused the reduced activity of this analog. Therefore an alternative explanation for its activity loss is required.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,314
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0060,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,263
Écart entre enseignants0,256 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueMolecular Medicine ReportsMême sujetGDF15 and Related BiomarkersTravaux en français237 207