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Enregistrement W2055544513 · doi:10.1074/jbc.m703895200

The Role of Distal S6 Hydrophobic Residues in the Voltage-dependent Gating of CaV2.3 Channels

2007· article· en· W2055544513 sur OpenAlexaff
Alexandra Raybaud, Ebru-Eylem Baspinar, François Dionne, Yolaine Dodier, Rémy Sauvé, Lucie Parent

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueIon channel regulation and function
Établissements canadiensUniversité de Montréal
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésGatingChemistryPower gatingBiophysicsVoltageBiologyElectrical engineeringEngineeringTransistor

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The hydrophobic locus VAVIM is conserved in the S6 transmembrane segment of domain IV (IVS6) in Ca(V)1 and Ca(V)2 families. Herein we show that glycine substitution of the VAVIM motif in Ca(V)2.3 produced whole cell currents with inactivation kinetics that were either slower (A1719G approximately V1720G), similar (V1718G), or faster (I1721G approximately M1722G) than the wild-type channel. The fast kinetics of I1721G were observed with a approximately +10 mV shift in its voltage dependence of activation (E(0.5,act)). In contrast, the slow kinetics of A1719G and V1720G were accompanied by a significant shift of approximately -20 mV in their E(0.5,act) indicating that the relative stability of the channel closed state was decreased in these mutants. Glycine scan performed with Val (349) in IS6, Ile(701) in IIS6, and Leu(1420) in IIIS6 at positions predicted to face Val(1720) in IVS6 also produced slow inactivating currents with hyperpolarizing shifts in the activation and inactivation potentials, again pointing out a decrease in the stability of the channel closed state. Mutations to other hydrophobic residues at these positions nearly restored the channel gating. Altogether these data indicate that residues at positions equivalent to 1720 exert a critical control upon the relative stability of the channel closed and open states and more specifically, that hydrophobic residues at these positions promote the channel closed state. We discuss a three-dimensional homology model of Ca(V)2.3 based upon Kv1.2 where hydrophobic residues at positions facing Val(1720) in IS6, IIS6, and IIIS6 play a critical role in stabilizing the closed state in Ca(V)2.3.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,182

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,248
Écart entre enseignants0,236 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations25
Publié2007
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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