Complementary expression patterns of six nonessential Caenorhabditis elegans core 2/I N-acetylglucosaminyltransferase homologues
Notice bibliographique
Résumé
The Caenorhabditis elegans genome contains 18 sequences related to mammalian core 2/I N-acetylglucosaminyltransferases. The six most closely related genes (gly-1 and gly-15 to gly-19) likely encode active enzymes, because are all transcribed and do not appear to be pseudogenes. Polypeptide divergence and the gene structures are both concordant with a common ancestor at the time of radiation from mammals that underwent three rounds of duplication and, most recently, a tandem duplication. Polypeptide alignments with mammalian homologues do not indicate whether the enzyme specificities are core 2, 4, or I-like or novel, but do clearly demonstrate the secondary structure characteristics of glycosyltransferases. The six homologues have essentially nonoverlapping expression patterns, unrelated by tissue type or cell lineage. The extent varies widely; gly-15 is expressed only in two gland cells, whereas gly-18 is broadly expressed in diverse cell types. gly-1, -15, -18 and -19 are expressed during adulthood; gly-16 and gly-17 appear to be restricted to embryonic or early larval stages. The parsimonious interpretation of the expression pattern and sequence data is that the catalytic activities are similar but with diverged promoters. Null alleles of three of the genes were generated without causing gross abnormality in homozygous animals. RNA-mediated interference experiments also failed to induce defects in the four genes tested. Nevertheless, the nematode has evolved six diverged core 2 GlcNAc-T-like genes, and we postulate that these arose in response to selection pressures to which C. elegans is not ordinarily subjected in the laboratory.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».