Determination of Microbial Communities beneath Livestock Burial Sites
Notice bibliographique
Résumé
A ten year old livestock burial site near Pierceland, Saskatchewan was continuously cored and analyzed for microbial communities at varying depths below the soil surface by molecular methods. 16S rRNA gene targets and quantitative PCR was utilized to provide a quantitative analysis of genomes per gram of soil and cpn-60 targets were used to amplify DNA for taxonomic profiling by 454 pyrosequencing. Quantification results demonstrate a three orders of magnitude greater difference in genomes at depths within and up to two meters below the burial trench as compared to a background core. Topsoil and depths below 6 meters show similar quantities of microbes for both the core through the burial trench and the background core. A total of 5905 OTUs was found at a variety of abundances in all of the 13 core samples that were analyzed. Taxonomic analysis indicated that the overall community composition changed considerably with increasing depth, and that the burial core community was distinct from the control core at the same depth. In the burial core, organisms that are associated with phosphate accumulation, nitrogen fixation, and ammonium oxidation were found in highest abundance near the surface (up to 2.5 m), while organisms associated with sulfate reduction were concentrated just below the burial depth (4.5-4.8 m). The microbial community at the burial site (3.75 m) was dominated by anaerobic microorganisms.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».