MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2057991078 · doi:10.13031/2013.36276

Determination of Microbial Communities beneath Livestock Burial Sites

2010· article· en· W2057991078 sur OpenAlexfundaboutno aff
Dyan Pratt, Tim Dumonceaux

Notice bibliographique

RevueASABE/CSBE North Central Intersectional Meeting · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenomics and Phylogenetic Studies
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesMinistry of Agriculture - Saskatchewan
Mots-clésPyrosequencingMicrobial population biologyMicroorganismTopsoilEnvironmental scienceBiologySoil waterEnvironmental chemistryGeologyEcologyPaleontologyBacteriaChemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

A ten year old livestock burial site near Pierceland, Saskatchewan was continuously cored and analyzed for microbial communities at varying depths below the soil surface by molecular methods. 16S rRNA gene targets and quantitative PCR was utilized to provide a quantitative analysis of genomes per gram of soil and cpn-60 targets were used to amplify DNA for taxonomic profiling by 454 pyrosequencing. Quantification results demonstrate a three orders of magnitude greater difference in genomes at depths within and up to two meters below the burial trench as compared to a background core. Topsoil and depths below 6 meters show similar quantities of microbes for both the core through the burial trench and the background core. A total of 5905 OTUs was found at a variety of abundances in all of the 13 core samples that were analyzed. Taxonomic analysis indicated that the overall community composition changed considerably with increasing depth, and that the burial core community was distinct from the control core at the same depth. In the burial core, organisms that are associated with phosphate accumulation, nitrogen fixation, and ammonium oxidation were found in highest abundance near the surface (up to 2.5 m), while organisms associated with sulfate reduction were concentrated just below the burial depth (4.5-4.8 m). The microbial community at the burial site (3.75 m) was dominated by anaerobic microorganisms.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,327
Score d'incertitude au seuil0,654

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,231
Écart entre enseignants0,218 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2010
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueASABE/CSBE North Central Intersectional MeetingMême sujetGenomics and Phylogenetic StudiesTravaux en français237 207