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Enregistrement W2058696029 · doi:10.1007/s13213-014-1007-8

Effect of mustard rhizobacteria on wheat growth promotion under cadmium stress: characterization of acdS gene coding ACC deaminase

2014· article· en· W2058696029 sur OpenAlexfundno aff
Venkadasamy Govindasamy, Murugesan Senthilkumar, K. Annapurna

Notice bibliographique

RevueAnnals of Microbiology · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueLegume Nitrogen Fixing Symbiosis
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesIndian Agricultural Research InstituteUniversity of WaterlooDepartment of Science and Technology, Ministry of Science and Technology, IndiaNational Research Centre
Mots-clésBiologyRhizobacteriaGenePseudomonasOpen reading frameGeneticsMicrobiologyAmino acidPeptide sequenceBiochemistryBacteria

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Ten mustard rhizobacterial isolates that utilize 1-aminocyclopropane-1-carboxylate (ACC) as sole nitrogen source were screened for plant growth-promoting traits. These isolates enhanced root elongation significantly and minimized ethylene synthesis in wheat seedlings under induced cadmium stress condition. The presence of acdS gene coding for ACC deaminase was tested through gene-specific PCR amplification and further confirmed by nucleic acid hybridization. acdS gene from isolates Ps 2-3 and Ps 7-12 selected on the basis of wheat growth promotion was cloned and sequenced. Sequence analysis showed an open reading frame of 1017 bp encoding a complete polypeptide with an identity of 86.4 % between each other and sharing 84–95 % similarity with the earlier reported acdS genes. The deduced protein sequences were highly conserved and shared a 95.2 % homology at the amino acid level. Eight and thirteen new amino acid residues were found in the protein sequence of Ps 2-3 and Ps 7-12 with variation in numbers of different peptidase acting sites and protein motifs. Based on 16S rDNA sequencing, the isolates Ps 2-3 and Ps 7-12 were identified as Pseudomonas sp. and Pseudomonas fluorescens , respectively.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,050
Score d'incertitude au seuil0,298

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,245
Écart entre enseignants0,225 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations20
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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