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Enregistrement W2058698228 · doi:10.4161/pri.25566

Implications of prion polymorphisms

2013· review· en· W2058698228 sur OpenAlexaff
Leonardo M. Cortez, Valerie L. Sim

Notice bibliographique

RevuePrion · 2013
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePrion Diseases and Protein Misfolding
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPRNPChronic wasting diseaseBiologyPhenotypeIncubation periodGeneticsPrion proteinIncubationIn vitroGeneDiseaseHost adaptationIn vivoStrain (injury)GenotypeScrapieBiochemistryGenomePathologyMedicineAnatomy

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The sequence of a host's prion protein (PrP) can affect that host's susceptibility to prion disease and is the primary basis for the species barrier to transmission. Yet within many species, polymorphisms of the prion protein gene (Prnp) exist, each of which can further affect susceptibility or influence incubation period, pathology and phenotype. As strains are defined by these features (incubation period, pathology, phenotype), polymorphisms may also lead to the preferential propagation or generation of certain strains. In our recent study of the mouse Prnp(a) and Prnp(b) polymorphisms (which produced the proteins PrP(a) and PrP(b), respectively), we found differences in aggregation tendency, strain adaptability and conformational variability. Comparing our in vitro data with that of in vivo studies, we found that differing incubation periods between Prnp(a) and Prnp(b) mice can primarily be explained on the basis of faster or more efficient aggregation of PrP(a). In addition, and more importantly, we found that the faithful propagation of strains in Prnp(b) mice can be explained by the ability of PrP(b) to adopt a wider range of conformations. This adaptability allows PrP(b) to successfully propagate the structural features of a seed. In contrast, Prnp(a) mice revert PrP(b) strains into PrP(a) -type strains, and overall they have a narrower distribution of incubation periods. This can be explained by PrP(a) having fewer preferred conformations. We propose that Prnp polymorphisms are one route by which certain prion strains may preferentially propagate. This has significant implications for prion disease, chronic wasting disease (CWD) in particular, as it is spreading through North America. Deer which are susceptible to CWD also carry polymorphisms which influence their susceptibility. If these polymorphisms also preferentially allow strain diversification and propagation, this may accelerate the crossing of species barriers and propagation of the disease up the food chain.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,996
Score d'incertitude au seuil0,720

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,040
Tête enseignante GPT0,334
Écart entre enseignants0,294 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations11
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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