MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2058828312 · doi:10.5197/j.2044-0588.2012.026.016

First report of <i>Phytophthora ilicis</i> causing twig blight on holly in Spain

2012· article· en· W2058828312 sur OpenAlexaboutno aff
C. Pintos, Carlos Rial, O. Aguín, J. P. Mansilla

Notice bibliographique

RevueNew Disease Reports · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Pathogens and Resistance
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSporangiumTwigBiologyPhytophthoraBlightAntheridiumBotanyPotato dextrose agarHorticultureCankerOosporeAgarSporeBacteria

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

During Phytophthora ramorum monitoring surveys at nurseries, parks and public gardens, a range of ornamental plants susceptible to infection with Phytophthora were extensively surveyed. In 2011, during these surveys in Santiago de Compostela (Galicia, NW Spain), several holly plants (Ilex aquifolium) were observed exhibiting black leaf spots, defoliation, twig blight, cankers and shoot dieback. Excised tissue from the leading edge of lesions on twigs and stems was plated on V8 agar semi-selective medium (Erwin & Ribeiro, 1996) and incubated for four days at 20°C in the dark. A Phytophthora sp. was consistently isolated. This was transferred to carrot agar (CA) and potato dextrose agar (PDA) (Fig. 1). Isolates exhibited optimal growth at 16-18°C and maximum growth at 25°C. Sporangia formed sympodially, were semipapillate, caducous with medium length pedicels 5-15 μm long (Fig. 2a) and had a length/width ratio of 1.2-1.6. Chlamydospores were not observed. Isolates were homothallic. Oogonia ranged from 17-27 μm in diameter (average 22.67 μm). Oospores were plerotic 14.6-23.6 μm in diameter (Fig. 2b-d). Antheridia were amphigynous, round, and occasionally elongated (Fig. 2b-d). Based on these morphological characters, cultures were identified as Phytophthora ilicis (Buddenhagen & Young, 1957). Identity was confirmed by DNA sequences analysis. DNA from isolates was extracted and the internal transcribed spacer (ITS) and translation elongation factor 1 alpha (EF-1 alpha) gene regions were amplified using primers DC6, ITS4 and ITS6 (Cooke et al., 2000) and ELONGF1-ELONGR1 (Kroon et al., 2004). PCR amplicons were sequenced and deposited in GenBank (Accession Nos. JQ609277 and JQ609278, respectively). Comparison of the sequences with others sequences available in GenBank showed 100% homology with those previously identified as P. ilicis (FJ8001947 and AY564127). A pathogenicity test of one representative isolate of P. ilicis was conducted using five detached stems of holly. A shallow wound was made with a scalpel on the middle of the stem. A 5 mm mycelial plug, from the margin of a seven-day-old culture growing on V8 agar, was inserted in every wound and sealed with Parafilm. The inoculated shoots were maintained at room temperature and 75% humidity. After 10 days stem blackened cankers and defoliation were observed (Fig. 3). Control stems, inoculated with sterile V8 agar, remained symptomless. P. ilicis was re-isolated from all inoculated stems but not from controls. To our knowledge this is the first report of Phytophthora ilicis causing leaf and twig blight on Ilex in Spain. P. ilicis is an invasive aerial Phytophthora characteristically found in cool temperate regions and it is host specific on holly. All cultivars of I. aquifolium are susceptible, although some other Ilex species and hybrids show resistance (Hall, 1991). P. ilicis was first reported and described in the western United States and is also recorded in Canada, U.K, the Netherlands and France.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Étude de cas · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,024
Score d'incertitude au seuil0,049

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0020,000
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,226
Écart entre enseignants0,207 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeÉtude de cas
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2012
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueNew Disease ReportsMême sujetPlant Pathogens and ResistanceTravaux en français237 207