Increased Prevalence of Methanosphaera stadtmanae in Inflammatory Bowel Diseases
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: The gut microbiota is associated with the modulation of mucosal immunity and the etiology of inflammatory bowel diseases (IBD). Previous studies focused on the impact of bacterial species on IBD but seldom suspected archaea, which can be a major constituent of intestinal microbiota, to be implicated in the diseases. Recent evidence supports that two main archaeal species found in the digestive system of humans, Methanobrevibacter smithii (MBS) and Methanosphaera stadtmanae (MSS) can have differential immunogenic properties in lungs of mice; with MSS but not MBS being a strong inducer of the inflammatory response. We thus aimed at documenting the immunogenic potential of MBS and MSS in humans and to explore their association with IBD. METHODS: To validate the immunogenicity of MBS and MSS in humans, peripheral blood mononuclear cells from healthy subjects were stimulated with these two microorganisms and the production of inflammatory cytokine TNF was measured by ELISA. To verify MBS and MSS prevalence in IBD, stool samples from 29 healthy control subjects and 29 patients suffering from IBD were collected for DNA extraction. Plasma was also collected from these subjects to measure antigen-specific IgGs by ELISA. Quantitative PCR was used for bacteria, methanogens, MBS and MSS quantification. RESULTS: Mononuclear cells stimulated with MSS produced higher concentrations of TNF (39.5 ng/ml) compared to MBS stimulation (9.1 ng/ml). Bacterial concentrations and frequency of MBS-containing stools were similar in both groups. However, the number of stool samples positive for the inflammatory archaea MSS was higher in patients than in controls (47% vs 20%). Importantly, only IBD patients developed a significant anti-MSS IgG response. CONCLUSION: The prevalence of MSS is increased in IBD patients and is associated with an antigen-specific IgG response.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».