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Enregistrement W2060283154 · doi:10.1021/jp8082858

Effect of Time on the Rate of Long Range Polymer Segmental Intramolecular Encounters

2009· article· en· W2060283154 sur OpenAlexaff
Mark Ingratta, Jean Duhamel

Notice bibliographique

RevueThe Journal of Physical Chemistry B · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueProtein Structure and Dynamics
Établissements canadiensUniversity of Waterloo
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPyreneExcited statePolymerChemistryKineticsMonomerReaction rate constantFluorescenceScalingPolystyreneAnalytical Chemistry (journal)Intramolecular forceCrystallographyStereochemistryPhysicsAtomic physicsOrganic chemistryOptics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The kinetics of encounters between the pyrene pendants randomly attached along a polystyrene chain (Py-PS) were monitored with a fluorescence blob model (FBM) as an external quencher was added to the solution to decrease the lifetime of the excited pyrene. The fluorescence decays acquired with the Py-PS samples yielded a measure of the volume Vblob probed by an excited pyrene during its lifetime in the form of N0blob, the number of monomers found within Vblob, and K0blob, which is inversely proportional to Vblob. Both N0blob and K0blob(-1) were found to increase with increasing probing time as the excited pyrene was allowed to probe a larger Vblob volume. The rate constant for pyrene-pyrene encounters was obtained from the product (KblobNblob). (KblobNblob) was found to decrease with increasing probing time, in agreement with scaling arguments suggesting that, as the probing time increases, the exited pyrene probes a larger Vblob where the local concentration of ground-state pyrenes in the polymer coil, [Py]loc, is smaller. K0blob, which is inversely proportional to Vblob, was found to scale as N0blob(alpha), where alpha equaled -1.5 and -1.2 in DMF and THF, respectively. The alpha exponents found for the Py-PS samples are in the same range as those found for other polymers exhibiting a random polymer coil conformation in solution and where much smaller than those obtained with more compact structured alpha-helical polypeptides randomly labeled with pyrene. Master curves were also constructed that describe how K0blob and the product (KblobNblob) scale as a function of solvent viscosity, probing time, and N0blob. These scaling laws illustrate the opposite effects that probing time and viscosity have on N0blob, V0blob, and the product (KblobNblob).

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,005
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,011

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,005
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,002
Tête enseignante GPT0,214
Écart entre enseignants0,212 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations14
Publié2009
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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