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Enregistrement W2060417514 · doi:10.1002/cbic.201500091

Direct Staudinger–Phosphonite Reaction Provides Methylphosphonamidates as Inhibitors of CE4 De‐N‐acetylases

2015· article· en· W2060417514 sur OpenAlexafffund
Rishikesh Ariyakumaran, Varvara Pokrovskaya, Dustin J. Little, P. Lynne Howell, Mark Nitz

Notice bibliographique

RevueChemBioChem · 2015
Typearticle
Langueen
DomaineChemistry
ThématiqueCarbohydrate Chemistry and Synthesis
Établissements canadiensSickKids FoundationHospital for Sick ChildrenUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésPeptidoglycanEnzymeBiofilmBiochemistryEscherichia coliBacteriaMicrobiologyLysinChemistryBiologyGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

De-N-acetylases of β-(1→6)-D-N-acetylglucosamine polymers (PNAG) and β-(1→4)-D-N-acetylglucosamine residues in peptidoglycan are attractive targets for antimicrobial agents. PNAG de-N-acetylases are necessary for biofilm formation in numerous pathogenic bacteria. Peptidoglycan de-N-acetylation facilitates bacterial evasion of innate immune defenses. To target these enzymes, transition-state analogue inhibitors containing a methylphosphonamidate have been synthesized through a direct Staudinger-phosphonite reaction. The inhibitors were tested on purified PgaB, a PNAG de-N-acetylase from Escherichia coli, and PgdA, a peptidoglycan de-N-acetylase from Streptococcus pneumonia. Herein, we describe the most potent inhibitor of peptidoglycan de-N-acetylases reported to date (Ki =80 μM). The minimal inhibition of PgaB observed provides insight into key structural and functional differences in these enzymes that will need to be considered during the development of future inhibitors.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,066
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,244
Écart entre enseignants0,225 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations11
Publié2015
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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