Purification, crystallization and preliminary X-ray analysis of the<i>Escherichia coli</i>glucose-1-phosphatase
Notice bibliographique
Résumé
Encoded by the agp gene, Escherichia coli glucose-1-phosphatase hydrolyzes glucose-1-phosphate in the periplasmic space of the bacterium. It is a potential drug-design target because inositol phosphatases have been identified as important virulence determinants in several human and animal pathogens. The enzyme was isolated and purified to homogeneity from a strain of E. coli CU1867 (an appA-deficient mutant). Crystals were obtained overnight by the equilibrium vapour-diffusion method from a solution containing 10 mg ml(-1) enzyme, 1.2 M ammonium sulfate and 25% polyethylene glycol monomethyl ether 5000 in 0.1 M MES at pH 6.5. The crystals belong to space group R3, with unit-cell parameters a = b = 156.0, c = 92.2 A. The diffraction limit was 2.6 A at a rotating-anode X-ray source; a 2.7 A resolution data set has been collected using light mineral oil as a cryoprotectant. The data set was 95.2% complete, with an R(sym) of 0.058. There were two monomers of glucose-1-phosphatase in the asymmetric unit, which correspond to a V(M) of 2.36 A Da(-1) and 47.5% solvent content. Self-rotation analysis unambiguously shows a twofold non-crystallographic symmetry.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,007 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».