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Enregistrement W2060802768 · doi:10.1186/1471-2202-9-17

Dimerization of the transmembrane domain of amyloid precursor proteins and familial Alzheimer's disease mutants

2008· article· en· W2060802768 sur OpenAlexafffund
Paul M. Gorman, Sanguk Kim, Meng Guo, Roman A. Melnyk, JoAnne McLaurin, Paul E. Fraser, James U. Bowie, Avijit Chakrabartty

Notice bibliographique

RevueBMC Neuroscience · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAlzheimer's disease research and treatments
Établissements canadiensUniversity of TorontoOntario Institute for Cancer Research
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchNational Institutes of HealthNational Institute of General Medical SciencesAlzheimer SocietyMuscular Dystrophy Association
Mots-clésTransmembrane domainAmyloid precursor proteinMutantTransmembrane proteinChemistryPeptideDimerAmyloid precursor protein secretaseMutationAlzheimer's diseaseBiochemistryBiologyAmino acidGeneMedicineDiseaseReceptorInternal medicine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Amyloid precursor protein (APP) is enzymatically cleaved by gamma-secretase to form two peptide products, either Abeta40 or the more neurotoxic Abeta42. The Abeta42/40 ratio is increased in many cases of familial Alzheimer's disease (FAD). The transmembrane domain (TM) of APP contains the known dimerization motif GXXXA. We have investigated the dimerization of both wild type and FAD mutant APP transmembrane domains. RESULTS: Using synthetic peptides derived from the APP-TM domain, we show that this segment is capable of forming stable transmembrane dimers. A model of a dimeric APP-TM domain reveals a putative dimerization interface, and interestingly, majority of FAD mutations in APP are localized to this interface region. We find that FAD-APP mutations destabilize the APP-TM dimer and increase the population of APP peptide monomers. CONCLUSION: The dissociation constants are correlated to both the Abeta42/Abeta40 ratio and the mean age of disease onset in AD patients. We also show that these TM-peptides reduce Abeta production and Abeta42/Abeta40 ratios when added to HEK293 cells overexpressing the Swedish FAD mutation and gamma-secretase components, potentially revealing a new class of gamma-secretase inhibitors.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,000
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,042
Tête enseignante GPT0,289
Écart entre enseignants0,246 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations81
Publié2008
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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