Mitochondrial DNA variation in water shrews (<i>Sorex</i><i>palustris</i>,<i>Sorex</i><i>bendirii</i>) from western North America: implications for taxonomy and phylogeography
Notice bibliographique
Résumé
Inter- and intra-specific variations in cytochrome b (Cytb) sequence were assessed in 22 specimens of Sorex palustris Richardson, 1828 and 6 specimens of Sorex bendirii (Merriam, 1884) from 20 locations in western North America. Phylogenetic analyses revealed three distinct clades: Boreal (S. p. palustris), Cordilleran (S. p. brooksi, S. p. navigator), and Coastal (S. b. palmeri, S. b. bendirii). Sequence divergence between the Boreal and the Coastal–Cordilleran lineages was 6.9%, while the divergence between the Coastal and the Cordilleran clades was 3.1%. Sorex palustris brooksi, a subspecies endemic to Vancouver Island, showed minor divergence from mainland samples of S. p. navigator. The results suggest that S. palustris may consist of two species: a boreal eastern form (S. palustris) and a Cordilleran form (S. navigator). The taxonomic validity of S. p. brooksi is unresolved. Distribution of the three clades are consistent with vicariance and isolation in coastal, Cordilleran, and eastern refugia in the Late Pliocene or Pleistocene. The Vancouver Island subspecies S. p. brooksi is probably derived from postglacial colonization in the Late Pleistocene.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».