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Enregistrement W2061052195 · doi:10.1093/hmg/ddu468

Tissue-specific responses to the LRPPRC founder mutation in French Canadian Leigh Syndrome

2014· article· en· W2061052195 sur OpenAlexafffundabout
Florin Sasarman, Takashi Nishimura, Hana Antonická, Woranontee Weraarpachai, Eric A. Shoubridge, Bruce G. Allen, G Charron, Lise Coderre, Christine DesRosiers, Catherine Laprise, C Morin, John D. Rioux

Notice bibliographique

RevueHuman Molecular Genetics · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMitochondrial Function and Pathology
Établissements canadiensMcGill UniversityMontreal Neurological Institute and Hospital
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésBiologyMolecular biologyMitochondrionGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

French Canadian Leigh Syndrome (LSFC) is an early-onset, progressive neurodegenerative disorder with a distinct pattern of tissue involvement. Most cases are caused by a founder missense mutation in LRPPRC. LRPPRC forms a ribonucleoprotein complex with SLIRP, another RNA-binding protein, and this stabilizes polyadenylated mitochondrial mRNAs. LSFC fibroblasts have reduced levels of LRPPRC and a specific complex IV assembly defect; however, further depletion of mutant LRPPRC results in a complete failure to assemble a functional oxidative phosphorylation system, suggesting that LRPPRC levels determine the nature of the biochemical phenotype. We tested this hypothesis in cultured muscle cells and tissues from LSFC patients. LRPPRC levels were reduced in LSFC muscle cells, resulting in combined complex I and IV deficiencies. A similar combined deficiency was observed in skeletal muscle. Complex IV was only moderately reduced in LSFC heart, but was almost undetectable in liver. Both of these tissues showed elevated levels of complexes I and III. Despite the marked biochemical differences, the steady-state levels of LRPPRC and mitochondrial mRNAs were extremely low, LRPPRC was largely detergent-insoluble, and SLIRP was undetectable in all LSFC tissues. The level of the LRPPRC/SLIRP complex appeared much reduced in control tissues by the first dimension blue-native polyacrylamide gel electrophoresis (BN-PAGE) analysis compared with fibroblasts, and even by second dimension analysis it was virtually undetectable in control heart. These results point to tissue-specific pathways for the post-transcriptional handling of mitochondrial mRNAs and suggest that the biochemical defects in LSFC reflect the differential ability of tissues to adapt to the mutation.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,916
Score d'incertitude au seuil0,961

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,261
Écart entre enseignants0,243 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations59
Publié2014
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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