Invasive Haemophilus influenzae in British Columbia: non-Hib and non-typeable strains causing disease in children and adults
Notice bibliographique
Résumé
OBJECTIVES: To characterize invasive Haemophilus influenzae and to examine the population at risk for invasive H. influenzae disease in British Columbia, Canada, 2008-2009. METHODS: H. influenzae recovered from individual patients were characterized by serotyping, biotyping, multilocus sequence typing (MLST), and antibiotic susceptibility testing. Age information was recorded from specimen requisition forms. RESULTS: Of the 98 cases, 66% were caused by non-typeable strains, followed by serotypes b (12%), a (10%), f (10%), and e (1%). Cases caused by serotypes b and f and non-typeable strains were mainly in adults over 18 years of age, while cases due to serotype a were mainly in children under the age of 2 years. Different sequence types were found in encapsulated strains according to their serotypes, and non-typeable strains had their own unique sequence types. No capsule switching was documented. Antibiotic resistance was common among non-typeable strains, with 31% identified as genotypic β-lactamase-negative ampicillin-resistant (BLNAR) strains. CONCLUSION: Invasive H. influenzae disease in a population vaccinated against Hib was age-dependent and involved both non-typeable and encapsulated strains. Adults were susceptible to invasive diseases due to non-typeable and serotype b and f strains, while in children, most diseases were due to serotype a bacteria.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».