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Enregistrement W2062374078 · doi:10.1111/pbr.12049

Gene expression profiles during embryo development in <i>Brassica napus</i>

2013· article· en· W2062374078 sur OpenAlexafffund
Prakash Venglat, Daoquan Xiang, Hui Yang, Lianglu Wan, Chabane Tibiche, Andrew R. S. Ross, Edwin Wang, Gopalan Selvaraj, Raju Datla

Notice bibliographique

RevuePlant Breeding · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Molecular Biology Research
Établissements canadiensBiotechnology Research InstitutePlant Biotechnology Institute
Organismes subventionnairesNational Research Council CanadaGenome CanadaGenome PrairieGenomic Health
Mots-clésBiologyEndospermEmbryoZygoteCanolaBrassicaEmbryogenesisGeneticsGeneProteomeCotyledonTranscriptomeGene expressionBotanyCell biology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract The seed in angiosperms is produced through coordinated development of the embryo, endosperm and seed coat. In dicots, most of the seed mass is taken up by the embryo with nutritional reserves stored in the cotyledons. During embryogenesis, well‐coordinated developmental and genetic programmes establish the embryonic body plan, and the associated complex metabolic pathways result in the production of diverse nutrients and deposition of important seed storage reserves. To gain insights into the genetic programmes that operate during embryo development in Brassica napus L. (canola), an important oilseed crop, we performed gene and protein expression analyses. We used the key stages from single‐cell zygote to mature embryo to generate comprehensive EST and proteome data sets. Analysis of these data sets identified 20 183 genes and 2607 proteins that are differentially expressed across different stages of embryo development. B. napus genes share high degree of homology with Arabidopsis and display stage‐specific and shared expression patterns associated with developmental and metabolic pathways. Together, this study has generated useful new molecular and genomic resources for embryo development in B. napus.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,026
Tête enseignante GPT0,211
Écart entre enseignants0,185 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations12
Publié2013
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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