Genetic analysis of Dolly Varden (<i>Salvelinus malma</i>) across its North American range: evidence for a contact zone in southcentral Alaska
Notice bibliographique
Résumé
Contact zones between divergent lineages of aquatic taxa have been described from the northeastern Pacific Ocean. We surveyed samples of Dolly Varden (Salvelinus malma) from their North American range for variation at 14 microsatellite DNA loci. After accounting for hybridization between Dolly Varden and co-occurring bull trout (Salvelinus confluentus) and Arctic char (Salvelinus alpinus), we found evidence for two genetic lineages of Dolly Varden consistent with the previously recognized subspecies, northern Dolly Varden (S. m. malma) and southern Dolly Varden (S. m. lordii). We documented a contact zone between the two subspecies from the eastern Alaska Peninsula to Cook Inlet, Alaska, where admixture values (i.e., the proportion of the genome estimated to be composed of northern Dolly Varden, QNDV) ranged between QNDV = 0.245 and 0.754 across about 700 ocean kilometres. Populations of Dolly Varden showing low admixture (i.e., less than 5%) were located a minimum of 346 km to the west to 1200 km to the southeast, respectively, from the contact zone. The two lineages of Dolly Varden probably stem from isolation and subsequent divergence in, and dispersal from, distinct northern and southern Pleistocene glacial refugia and substantiate the treatment of S. malma as two subspecies and as at least two designatable units under Canada’s Species at Risk Act.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».