Major Photoaffinity Drug Binding Sites in Multidrug Resistance Protein 1 (MRP1) Are within Transmembrane Domains 10–11 and 16–17
Notice bibliographique
Résumé
MRP1 is an ABC (or ATP binding cassette) membrane transport protein shown to confer resistance to structurally dissimilar drugs. Studies of MRP1 topology suggested the presence of a hydrophobic N-domain with five potential membrane-spanning domains linked to an MDR1-like core (MSD1-NBD1-L1-MSD2-NBD2) by an intracellular linker domain (L0). MRP1-mediated multidrug resistance is thought to be due to enhanced drug efflux. However, little is known about MRP1-drug interaction and its drug binding site(s). We previously developed several photoreactive probes to study MRP1-drug interactions. In this report, we have used eight MRP1-HA variants that were modified to have hemagglutinin A (HA) epitopes inserted at different sites in MRP1 sequence. Exhaustive in-gel digestion of all IAARh123 photoaffinity-labeled MRP1-HA variants revealed the same profile of photolabeled peptides as seen for wild type MRP1. Photolabeling of the different MRP1-HA variants followed by digestion with increasing concentrations of trypsin or Staphylococcus aureus V8 protease (1:800 to 1:5 w/w) and immunoprecipitation with anti-HA mAb identified two small photolabeled peptides ( approximately 6-7 kDa) from MRP1-HA(574) and MRP1-HA(1222). Based on the location of the HA epitopes in the latter variants together with molecular masses of the two peptides, the photolabeled amino acid residues were localized to MRP1 sequences encoding transmembranes 10 and 11 of MSD1 (Ser(542)-Arg(593)) and transmembranes 16 and 17 of MSD2 (Cys(1205)-Glu(1253)). Interestingly, the same sequences in MRP1 were also photolabeled with a structurally different photoreactive drug, IACI, confirming the significance of transmembranes 10, 11, 16 and 17 in MRP1 drug binding. Taken together, the results in this study provide the first delineation of the drug binding site(s) of MRP1. Furthermore, our findings suggest the presence of common drug binding site(s) for structurally dissimilar drugs.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».