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Enregistrement W2062547744 · doi:10.1021/bi015829k

Thermodynamic Binding Parameters of Individual Epitopes of Multivalent Carbohydrates to Concanavalin A As Determined by “Reverse” Isothermal Titration Microcalorimetry

2001· article· en· W2062547744 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueBiochemistry · 2001
Typearticle
Langueen
DomaineChemistry
Thématiquethermodynamics and calorimetric analyses
Établissements canadiensUniversity of Ottawa
Organismes subventionnairesNational Center for Research ResourcesNational Cancer Institute
Mots-clésEpitopeIsothermal microcalorimetryChemistryLectinTitrationConcanavalin AIsothermal titration calorimetryBinding constantDivalentCooperativityBinding siteStereochemistryBiochemistryEnthalpyThermodynamicsOrganic chemistryAntigenBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The preceding paper [Dam, T. K., Roy, R., Pagé, D., and Brewer, C. F. (2002) Biochemistry 41, 1351-1358] demonstrated that Hill plots of isothermal titration microcalorimetry (ITC) data for the binding of di-, tri-, and tetravalent carbohydrate analogues possessing terminal 3,6-di-O-(alpha-D-mannopyranosyl)-alpha-D-mannopyranoside residues to the lectin concanavalin A (ConA) show increasing negative cooperativity upon binding of the analogues to the lectin. The present study demonstrates "reverse" ITC experiments in which the lectin is titrated into solutions of di- and trivalent analogues. The results provide direct determinations of the thermodynamics of binding of ConA to the individual epitopes of the two multivalent analogues. The n values (number of binding sites per carbohydrate molecule) derived from reverse ITC demonstrate two functional binding epitopes on both the di- and trivalent analogues, confirming previous "normal" ITC results with the two carbohydrates [Dam, T. K., Roy, R., Das, S. K., Oscarson, S., and Brewer, C. F. (2000) J. Biol. Chem. 275, 14223-14230]. The reverse ITC measurements show an 18-fold greater microscopic affinity constant of ConA for the first epitope of the divalent analogue versus its second epitope and a 53-fold greater microscopic affinity constant of ConA binding to the first epitope of the trivalent analogue versus its second epitope. The data also demonstrate that the microscopic enthalpies of binding of the two epitopes on the di- and trivalent analogues are essentially the same and that differences in the microscopic K(a) values of the epitopes are due to their different microscopic entropies of binding values. These findings are consistent with the increasing negative Hill coefficients of these analogues binding to ConA in the previous paper.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,005
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,249
Écart entre enseignants0,237 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle