Late presentation of cancer in compound heterozygote PMS2 mutation carrier
Notice bibliographique
Résumé
Turcot syndrome is clinically characterized by the occurrence of primary brain tumors, colorectal cancer and/or accompanying adenomas. It has been described as both an autosomal dominant and recessive condition and mutations in APC, MLH1, MSH2, MSH6 and PMS2 have been reported. Constitutional Mismatch repair (CMMR) deficiency is a variant of Lynch syndrome (LS) associated with biallelic MMR mutations. Individuals present with NF1 manifestations and generally develop hematological malignancies, brain tumors and/or LS associated cancers, in the first or second decade of life. We report an individual with café au lait macules (CAL) and a history of glioblastoma at 31 and proximal colon cancer at 32. Family history includes a mother with hematologic cancers in her 60’s, maternal half uncle with colon cancer at 48, maternal half uncle with renal cancer and three maternal great uncles with colon cancer. The proband underwent a standard clinical assessment in the cancer genetics clinic. Immunohistochemistry (IHC) and genetic testing for MLH1, MSH2, MSH6 and PMS2 was completed followed by microsatellite (MSI) studies and imunohistochemistry (IHC) for PMS2. IHC on tissue from the patient’s colorectal tumor showed very weak staining of MLH1 in both the tumor and benign colonic mucosa and lymphocytes. No mutation was detected by sequencing and MLPA for MLH1, MSH2 and MSH6. MSI was high and subsequent IHC for PMS2 showed absent staining. Sequencing of PMS2 identified two changes: 2019 delT resulting in a frameshift mutation at codon 673 and 2249G>A (G750D), a missense change in a fully conserved region. In-silico analysis by SIFT [ http://sift.jcvi.org/ ] and Polyphen [ http://genetics.bwh.harvard.edu/pph/ ] predict the missense change to be damaging. This change has also been previously reported as a biallelic mutation in individual with a complete PMS2 gene deletion and history of rectal cancer and brain tumor at 22 and 23 respectively [ 1 ]. The proband’s mother is currently being tested to confirm the two PMS2 mutations are in trans. We report an individual with Turcot syndrome and biallelic PMS2 mutations who developed her first cancer in her 30’s. In this case, biallelic mutations were suspected due to the history of CALs. This result is in keeping with recent reports suggesting a milder phenotype may exist in individuals with biallelic PMS2 mutations, particularly in those where one mutation may be hypomorphic resulting in some residual MMR proficiency.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».