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Enregistrement W2062855385 · doi:10.1074/jbc.m113.458661

Endogenous APOBEC3A DNA Cytosine Deaminase Is Cytoplasmic and Nongenotoxic

2013· article· en· W2062855385 sur OpenAlexfundno aff
Allison M. Land, Emily K. Law, Michael A. Carpenter, Lela Lackey, William L. Brown, Reuben S. Harris

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA Interference and Gene Delivery
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Center for Advancing Translational SciencesNational Institute of General Medical SciencesNational Institute of Dental and Craniofacial ResearchNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésCytosine deaminaseTransfectionInterferonInnate immune systemMolecular biologyHEK 293 cellsCD14Cell cultureBiologyCytotoxicityChemistryCell biologyBiochemistryImmune systemIn vitroVirologyGeneImmunologyGeneticsFlow cytometryGenetic enhancement

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

APOBEC3A (A3A) is a myeloid lineage-specific DNA cytosine deaminase with a role in innate immunity to foreign DNA. Previous studies have shown that heterologously expressed A3A is genotoxic, suggesting that monocytes may have a mechanism to regulate this enzyme. Indeed, we observed no significant cytotoxicity when interferon was used to induce the expression of endogenous A3A in CD14 + -enriched primary cells or the monocytic cell line THP-1. In contrast, doxycycline-induced A3A in HEK293 cells caused major cytotoxicity at protein levels lower than those observed when CD14 + cells were stimulated with interferon. Immunofluorescent microscopy of interferon-stimulated CD14 + and THP-1 cells revealed that endogenous A3A is cytoplasmic, in stark contrast to stably or transiently transfected A3A, which has a cell-wide localization. A3A constructs engineered to be cytoplasmic are also nontoxic in HEK293 cells. These data combine to suggest that monocytic cells use a cytoplasmic retention mechanism to control A3A and avert genotoxicity during innate immune responses. Background: APOBEC3A is a potentially genotoxic DNA cytosine deaminase expressed in myeloid lineage cells. Results: Exogenous APOBEC3A genotoxicity correlates with expression level and nuclear localization. Endogenous APOBEC3A is nontoxic and cytoplasmic, despite its capacity to be highly induced by interferon. Conclusion: Cytoplasmic localization prevents endogenous APOBEC3A from accessing nuclear DNA. Significance: Endogenous APOBEC3A is not genotoxic.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,526

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,227
Écart entre enseignants0,205 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations83
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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