LitR, a new transcriptional activator in <i>Vibrio fischeri</i>, regulates luminescence and symbiotic light organ colonization
Notice bibliographique
Résumé
Vibrio fischeri is the bacterial symbiont within the light-emitting organ of the sepiolid squid Euprymna scolopes. Upon colonizing juvenile squids, bacterial symbionts grow on host-supplied nutrients, while providing a bioluminescence that the host uses during its nocturnal activities. Mutant bacterial strains that are unable to emit light have been shown to be defective in normal colonization. A 606 bp open reading frame was cloned from V. fischeri that encoded a protein, which we named LitR, that had about 60% identity to four related regulator proteins: Vibrio cholerae HapR, Vibrio harveyi LuxR, Vibrio parahaemolyticus OpaR and Vibrio vulnificus SmcR. When grown in culture, cells of V. fischeri strain PMF8, in which litR was insertionally inactivated, were delayed in the onset of luminescence induction and emitted only about 20% as much light per cell as its parent. Protein-binding studies suggested that LitR enhances quorum sensing by regulating the transcription of the luxR gene. Interestingly, when competed against its parent in mixed inocula, PMF8 became the predominant symbiont present in 83% of light organs. Thus, the litR mutation appears to represent a novel class of mutations in which the loss of a regulatory gene function enhances the bacterium's competence in initiating a benign infection.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».