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Enregistrement W2063340907 · doi:10.5539/ijb.v1n2p71

Molecular Cloning and Characterization of a Putative BnHEC3 Gene in Oilseed Rape (Brassica Napus)

2009· article· en· W2063340907 sur OpenAlexvenueno aff
Xiaoli Tan, Lili Zhang, Zongwei Xia

Notice bibliographique

RevueInternational Journal of Biology · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Molecular Biology Research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesGovernment of Jiangsu Province
Mots-clésBrassicaOpen reading frameComplementary DNABiologyGeneArabidopsisArabidopsis thalianaGeneticsCloning (programming)In silicoRapid amplification of cDNA endsCoding regionMolecular cloningGenomeHomologous chromosomeMolecular biologyPeptide sequenceBotanyMutant

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

HECATE3 (HEC3) is an important transcription factor involved in regulating the carpel and transmitting tractdevelopment in Arabidopsis thaliana. The homologous gene of HEC3 in Brassica napus (designed as BnHEC3) wasobtained by in silico cloning and rapid amplification of cDNA end (RACE) method. BnHEC3 obtained from cDNA is of748 bp, containing an open reading frame (ORF) of 546bp and coding a peptide of 181 amino acid residues. Sequencealignment revealed that BnHEC3 is highly homologous to HEC3 in Arabidopsis thaliana, especially in bHLH region,which is sharing nearly 100% identity, and the polygenetic analysis indicated that BnHEC3 belongs to atypical bHLHprotein family. RT-PCR results showed that BnHEC3 is mainly expressed in young leave. Southern blotting analysisindicated that BnHEC3 has at least three copies in Brassica napus genome. The transient expression of BnHEC3-sGFPin onion epidermic cells showed that BnHEC3 localized in nuclei. These features implied that BnHEC3 functions asHEC3, and may be involved in the development of female reproductive tissues in Brassica napus.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,276
Écart entre enseignants0,263 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2009
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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