MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W2063408296 · doi:10.1371/journal.pone.0109973

MicroRNA Related Polymorphisms and Breast Cancer Risk

2014· article· en· W2063408296 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevuePLoS ONE · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMicroRNA in disease regulation
Établissements canadiensUniversité de MontréalMcGill UniversityMcGill University Health CentreRoyal Victoria Regional Health CentreUniversité LavalRoyal Victoria HospitalCentre hospitalier universitaire de QuébecSt. Michael's HospitalMount Sinai HospitalLunenfeld-Tanenbaum Research InstitutePublic Health OntarioUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesMedical Research and Materiel CommandNational Cancer InstituteUniversitätsklinikum Hamburg-EppendorfCancer Council TasmaniaMedical Research CouncilU.S. ArmyNational Institutes of HealthRheinische Friedrich-Wilhelms-Universität BonnMinistero dello Sviluppo EconomicoAgence Nationale de Sécurité Sanitaire de l’Alimentation, de l’Environnement et du TravailAgence Française de Sécurité Sanitaire de l'Environnement et du TravailNational Health and Medical Research CouncilOulun YliopistoDeutsche KrebshilfeMedizinischen Hochschule HannoverNorges ForskningsrådInstitut National Du CancerLeids Universitair Medisch CentrumVetenskapsrådetStockholms Läns LandstingKuopion Yliopistollinen SairaalaCanadian Institutes of Health ResearchGeneral Secretariat for Research and TechnologyBundesministerium für Bildung und ForschungMinisterio de Economía y CompetitividadDeutsche Gesetzliche UnfallversicherungNederlandse Organisatie voor Wetenschappelijk OnderzoekErasmus Medisch CentrumFonds Wetenschappelijk OnderzoekCancerfondenKarolinska InstitutetUniversity of CambridgeZonMwRobert Bosch StiftungNational Breast Cancer FoundationEuropean CommissionAcademy of FinlandKing's College LondonMcGill UniversityBreast Cancer Research FoundationKWF KankerbestrijdingHerlev HospitalFondation du cancer du sein du QuébecWellcome TrustCancer Research UKRoswell Park Cancer InstituteNational Institute for Health and Care ResearchAssociazione Italiana per la Ricerca sul CancroItä-Suomen YliopistoMinistère du Développement Économique, de l’Innovation et de l’ExportationLon V. Smith FoundationEuropean Social FundAgency for Science, Technology and ResearchMcGill University Health CentreDavid F. and Margaret T. Grohne Family FoundationLigue Contre le CancerDeutsches KrebsforschungszentrumHelsingin ja Uudenmaan SairaanhoitopiiriNIHR Biomedical Research Centre, Royal Marsden NHS Foundation Trust/Institute of Cancer ResearchFondation de FranceCancer Council VictoriaCalifornia Department of Public HealthSundhed og Sygdom, Det Frie ForskningsrådU.S. Department of Health and Human ServicesInstituto de Salud Carlos IIIOhio State UniversityCancer Care OntarioSusan G. Komen for the Cure
Mots-clésSingle-nucleotide polymorphismBreast cancerDroshaGenome-wide association studyOdds ratiomicroRNACase-control studyOncologyBiologyEstrogen receptorCancerBioinformaticsMedicineInternal medicineGeneticsGenotypeGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Genetic variations, such as single nucleotide polymorphisms (SNPs) in microRNAs (miRNA) or in the miRNA binding sites may affect the miRNA dependent gene expression regulation, which has been implicated in various cancers, including breast cancer, and may alter individual susceptibility to cancer. We investigated associations between miRNA related SNPs and breast cancer risk. First we evaluated 2,196 SNPs in a case-control study combining nine genome wide association studies (GWAS). Second, we further investigated 42 SNPs with suggestive evidence for association using 41,785 cases and 41,880 controls from 41 studies included in the Breast Cancer Association Consortium (BCAC). Combining the GWAS and BCAC data within a meta-analysis, we estimated main effects on breast cancer risk as well as risks for estrogen receptor (ER) and age defined subgroups. Five miRNA binding site SNPs associated significantly with breast cancer risk: rs1045494 (odds ratio (OR) 0.92; 95% confidence interval (CI): 0.88-0.96), rs1052532 (OR 0.97; 95% CI: 0.95-0.99), rs10719 (OR 0.97; 95% CI: 0.94-0.99), rs4687554 (OR 0.97; 95% CI: 0.95-0.99, and rs3134615 (OR 1.03; 95% CI: 1.01-1.05) located in the 3' UTR of CASP8, HDDC3, DROSHA, MUSTN1, and MYCL1, respectively. DROSHA belongs to miRNA machinery genes and has a central role in initial miRNA processing. The remaining genes are involved in different molecular functions, including apoptosis and gene expression regulation. Further studies are warranted to elucidate whether the miRNA binding site SNPs are the causative variants for the observed risk effects.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,267
Score d'incertitude au seuil0,360

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,201
Écart entre enseignants0,193 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle