<i>Streptococcus pneumoniae</i>and<i>Staphylococcus aureus</i>Pneumonia Induce Distinct Metabolic Responses
Notice bibliographique
Résumé
Pneumonia is an infection of the lower respiratory tract caused by microbial pathogens. Two such pathogens, Streptococcus pneumoniae and Staphylococcus aureus, are the most common causes of community-acquired and hospital-acquired pneumonia respectively. Each expresses strains highly resistant to penicillin and other antibiotics, and a significant number of people succumb to infection by these pathogens every year. Urinary metabolite changes in a C57Bl/6 mouse model with lung infection from either S. pneumoniae or S. aureus were characterized using multivariate targeted profiling data obtained from (1)H NMR spectra. Marked changes in the urinary metabolite profile occurred within 24 h after infection with either pathogen. Specifically, significant decreases in TCA cycle intermediates, coupled with increases in fucose, creatine, and taurine were observed in the urine of S. pneumoniae-treated mice. Infection with S. aureus resulted in the decrease of a number of urinary metabolites including 1-methylnicotinamide, 3-methyl-2-oxovalerate, 2-oxoisocaproate, N-isovaleroylglycine and others. Disturbances in gut-derived microbial metabolites were also observed. Analysis of metabolic trajectory data indicated that, as the mice recovered from infection, their urinary metabolic profile became similar to that of the preinfected state. These results underline the potential of metabolomics as a tool for diagnosis, health monitoring, and drug development, and show its usefulness for understanding microbial-host interactions.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».