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Enregistrement W2063855268 · doi:10.1371/journal.pone.0045633

Sirtuin 1 Facilitates Generation of Induced Pluripotent Stem Cells from Mouse Embryonic Fibroblasts through the miR-34a and p53 Pathways

2012· article· en· W2063855268 sur OpenAlexaff
Yin Lau Lee, Qian Peng, Sze Wan Fong, Andy C. H. Chen, Ckf Lee, Ernest Hung Yu Ng, András Nagy, William S.B. Yeung

Notice bibliographique

RevuePLoS ONE · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePluripotent Stem Cells Research
Établissements canadiensLunenfeld-Tanenbaum Research InstituteUniversity of TorontoMount Sinai Hospital
Organismes subventionnairesUniversity of Hong Kong
Mots-clésReprogrammingHomeobox protein NANOGInduced pluripotent stem cellCell biologyGene knockdownSirtuin 1BiologyEmbryonic stem cellSirtuinSOX2Rex1KLF4ChemistryMolecular biologyAcetylationDownregulation and upregulationCell cultureCellBiochemistryGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Forced-expression of transcription factors can reprogram somatic cells into induced pluripotent stem cells (iPSC). Recent studies show that the reprogramming efficiency can be improved by inclusion of small molecules that regulate chromatin modifying enzymes. We report here that sirtuin 1 (SIRT1), a member of the sirtuin family of NAD(+)-dependent protein deacetylases, is involved in iPSC formation. By using an efficient mouse secondary fibroblast reprogramming system with doxycycline (DOX) inducible Yamanaka's transcription factors delivered by piggyBac (PB) transposition (2°F/1B MEF), we show that SIRT1 knockdown decreased while resveratrol (RSV) increased the efficiency of iPSC formation. The treatments were associated with altered acetylated p53 and its downstream Nanog but not p21 expression. The stimulatory effect was also confirmed by SIRT1 over-expression, which stimulated the formation of colonies with induced Nanog and reduced p21 expression. Furthermore, the effects of RSV and SIRT1 knockdown on reprogramming were most pronounced during the initiation phase of reprogramming. MicroRNA-34a is a known regulator of SIRT1. Its inhibitor increased, while its mimics reduced iPSC formation. The stimulatory effect of SIRT1 during reprogramming was also confirmed in the primary MEF. RSV increased while tenovin-6, a small molecule that activates p53 through SIRT1 inhibition, suppressed reprogramming. In conclusion, SIRT1 enhances iPSC generation, in part, through deacetylation of p53, inhibition of p21 and enhancement of Nanog expression.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,563

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,084
Tête enseignante GPT0,243
Écart entre enseignants0,159 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations70
Publié2012
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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