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Enregistrement W2064411615 · doi:10.2147/tacg.s10604

Alpha1-antitrypsin deficiency: a clinical-genetic overview

2011· article· en· W2064411615 sur OpenAlexaff
Raja T. Abboud, Tanya N. Nelson, Benjamin Jung, André Mattman

Notice bibliographique

RevueThe Application of Clinical Genetics · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueChronic Obstructive Pulmonary Disease (COPD) Research
Établissements canadiensSt. Paul's HospitalChildren's & Women's Health Centre of British ColumbiaUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésAlpha 1-antitrypsin deficiencyMedicineAlleleLiver diseaseDiseaseGenetic disorderHepatitisGenotypeGastroenterologyInternal medicineImmunologyPathologyGeneBiologyGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Severe α1-antitrypsin deficiency (AATD) is an inherited disorder, leading to development of emphysema in smokers at a relatively young age with disability in their forties or fifties. The emphysema results from excessive elastin degradation by neutrophil elastase as a result of the severe deficiency of its major inhibitor α1-antitrypsin (AAT). The AAT expression is determined by the SERPINA1 gene which expresses codominant alleles. The three most common alleles are the normal M, the S with plasma levels of 60% of normal, and the severely deficient Z with levels of about 15% of normal. Homozygosity for the Z mutant allele is associated with retention of abnormal AAT in the liver, which may lead to neonatal hepatitis, liver disease in children, and liver disease in adults. Regular intravenous infusions of purified human AAT (AAT augmentation therapy) have been used to partially correct the biochemical defect and protect the lung against further injury. Two randomized controlled trials showed a trend of slower progression of emphysema by chest computerized tomography. Integrated analysis of these two studies indicated significantly slower progression of emphysema. AAT is quantified by immunologic measurement of AAT in serum, the phenotype characterized by isoelectric focusing, the common genotypes by targeted DNA analysis, and by sequencing the coding region of the gene when the AAT abnormality remains undefined. AATD is often unrecognized, and diagnosis delayed. Testing for AATD is recommended in patients with chronic irreversible airflow obstruction, especially in those with early onset of disease or positive family history. Testing is also recommended for immediate family members of those with AATD, asthmatics with persistent airflow obstruction, and infants and older subjects with unexplained liver disease. There are over 100 different AAT gene variants; most are rare and only some are associated with clinical disease.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0040,002
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,189
Tête enseignante GPT0,455
Écart entre enseignants0,266 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations43
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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