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Enregistrement W2064555218 · doi:10.3109/00498250903330348

Characterization of the porcine constitutive androstane receptor (CAR) and its splice variants

2009· article· en· W2064555218 sur OpenAlexafffund
Matthew Gray, J. Peacock, E. James Squires

Notice bibliographique

RevueXenobiotica · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueHormonal and reproductive studies
Établissements canadiensUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaUniversity of Texas Southwestern Medical Center
Mots-clésConstitutive androstane receptorAgonistPregnane X receptorChemistryAndrogen receptorDihydrotestosteroneReceptorLuciferaseCYP3A4Farnesoid X receptorInverse agonistMolecular biologyPharmacologyBiologyInternal medicineNuclear receptorAndrogenBiochemistryCytochrome P450GeneTranscription factorMedicineEnzymeProstate cancerTransfection

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Porcine constitutive androstane receptor (CAR; NR1I3) was cloned and compared for homology and activity with mouse and human CAR (mCAR, hCAR). Porcine CAR (pgCAR) was 86% and 75% homologous to hCAR at the nucleotide and protein levels. Five alternatively spliced variants of pgCAR were identified, each of which generated a truncated protein product. Real-time polymerase chain reaction (PCR) analyses showed that these variants were present in pig liver cDNA samples from 4.61% to 9.20% of total pgCAR. pgCAR and hCAR responded similarly to more ligands than did hCAR and mCAR. The known hCAR agonist (6-(4-chlorophenyl)imidazo[2,1-b][1,3]thiazole-5-carbaldehyde-O-(3,4-dichlorobenzyl)oxime (CITCO) activated pgCAR, while the murine agonist 1,4 bis[2-(3,5-dichloropyridyloxy)] benzene (TCPOBOP) had no effect. 5beta-dihydrotestosterone was identified as a novel inverse agonist of both pgCAR and hCAR. pgCAR splice variant 2 (SV2) had a dose-dependent dominant negative effect on the activity of wild-type pgCAR in dual luciferase assays. SV2 had no effect against pgPXR (pregnane X receptor) or pgFXR (farnesoid X receptor) activity when using PXR- or FXR-specific reporters.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,703
Score d'incertitude au seuil0,189

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,238
Écart entre enseignants0,226 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations21
Publié2009
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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