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Enregistrement W2064920658 · doi:10.1074/jbc.m310448200

Methanethiosulfonate Derivatives of Rhodamine and Verapamil Activate Human P-glycoprotein at Different Sites

2003· article· en· W2064920658 sur OpenAlexaff
Tip W. Loo, M. Claire Bartlett, David M. Clarke

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2003
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueDrug Transport and Resistance Mechanisms
Établissements canadiensUniversity of TorontoCanadian Institutes of Health Research
Organismes subventionnairesNational Cancer InstituteNational Institutes of Health
Mots-clésRhodamineRhodamine 123P-glycoproteinChemistryTransmembrane domainEffluxBiochemistryCysteineMutantTransmembrane proteinMembraneMultiple drug resistanceEnzymeReceptor

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The human multidrug resistance P-glycoprotein (P-gp, ABCB1) actively extrudes a broad range of potentially cytotoxic compounds out of the cell. Key steps in understanding the transport process are binding of drug substrates in the transmembrane domains, initiation of ATPase activity, and subsequent drug efflux. We used cysteine-scanning mutagenesis of the transmembrane segment residues and reaction with the thiol-reactive drug substrate analog of rhodamine, methane-thiosulfonate-rhodamine (MTS-rhodamine), to test whether P-gp could be trapped in an activated state with high levels of ATPase activity. The presence of such an activated P-gp could be used to further investigate P-gp-drug substrate interactions. Single cysteine mutants (149) were treated with MTS-rhodamine, and ATPase activities were determined after removal of unreacted MTS-rhodamine. One mutant, F343C(TM6), showed a 5.8-fold increase in activity after reaction with MTS-rhodamine. Pre-treatment of mutant F343C with rhodamine B protected it from activation by MTS-rhodamine, indicating that residue Cys-343 contributes to the rhodamine-binding site. The ATPase activity of MTS-rhodamine-treated mutant F343C, however, was not stimulated further by colchicine or calcein-AM. By contrast, verapamil and Hoechst 33342 stimulated and inhibited, respectively, the ATPase activity of the MTS-rhodamine-treated mutant F343C. These results indicate that the MTS-rhodamine binding site overlaps that of colchicine and calcein-AM but not that of verapamil and Hoechst 33342 within the common drug-binding pocket.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,033
Tête enseignante GPT0,274
Écart entre enseignants0,241 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations76
Publié2003
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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