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Enregistrement W2065020908 · doi:10.1002/cbic.201200493

Two Synthetic Antibodies that Recognize and Neutralize Distinct Proteolytic Forms of the Ebola Virus Envelope Glycoprotein

2012· article· en· W2065020908 sur OpenAlexafffund
Jayne F. Koellhoffer, Gang Chen, Rohini G. Sandesara, Shridhar Bale, Erica Ollmann Saphire, Kartik Chandran, Sachdev S. Sidhu, Jonathan R. Lai

Notice bibliographique

RevueChemBioChem · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueViral Infections and Outbreaks Research
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesCanadian Institutes of Health ResearchNational Institute of General Medical SciencesU.S. Public Health Service
Mots-clésEbola virusFiloviridaeViral envelopeEpitopeViral entryGlycoproteinAntibodyProteasesVirologyProteolysisLipid bilayer fusionChemistryEndosomeBiologyVirusBiochemistryViral replicationCellParamyxoviridaeEnzymeImmunology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Ebola virus (EBOV) is a highly pathogenic member of the Filoviridae family of viruses that causes severe hemorrhagic fever. Infection proceeds through fusion of the host cell and viral membranes, a process that is mediated by the viral envelope glycoprotein (GP). Following endosomal uptake, a key step in viral entry is the proteolytic cleavage of GP by host endosomal cysteine proteases. Cleavage exposes a binding site for the host cell receptor Niemann-Pick C1 (NPC1) and may induce conformational changes in GP leading to membrane fusion. However, the precise details of the structural changes in GP associated with proteolysis and the role of these changes in viral entry have not been established. Here, we have employed synthetic antibody technology to identify antibodies targeting EBOV GP prior to and following proteolysis (i.e. in the "uncleaved" [GP(UNCL)] and "cleaved" [GP(CL)] forms). We identified antibodies with distinct recognition profiles: Fab(CL) bound preferentially to GP(CL) (EC(50)=1.7 nM), whereas Fab(UNCL) bound specifically to GP(UNCL) (EC(50)=75 nM). Neutralization assays with GP-containing pseudotyped viruses indicated that these antibodies inhibited GP(CL)- or GP(UNCL)-mediated viral entry with specificity matching their recognition profiles (IC(50): 87 nM for IgG(CL); 1 μM for Fab(UNCL)). Competition ELISAs indicate that Fab(CL) binds an epitope distinct from that of KZ52, a well-characterized EBOV GP antibody, and from that of the luminal domain of NPC1. The binding epitope of Fab(UNCL) was also distinct from that of KZ52, suggesting that Fab(UNCL) binds a novel neutralization epitope on GP(UNCL). Furthermore, the neutralizing ability of Fab(CL) suggests that there are targets on GP(CL) available for neutralization. This work showcases the applicability of synthetic antibody technology to the study of viral membrane fusion, and provides new tools for dissecting intermediates of EBOV entry.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,014
Score d'incertitude au seuil0,402

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,036
Tête enseignante GPT0,310
Écart entre enseignants0,274 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations28
Publié2012
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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