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Enregistrement W2065203200 · doi:10.1186/1742-4690-9-s2-p348

DNA vaccines that express the MPER of HIV-1 gp41 elicit different antibodies depending upon their transmembrane and cytoplasmic domains

2012· article· en· W2065203200 sur OpenAlexaff
JK Scott, N. Gulzar, Kristina-Ana Klaric, TM Ross, Shan Lu, S Wang

Notice bibliographique

RevueRetrovirology · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueHIV Research and Treatment
Établissements canadiensSimon Fraser University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésGp41Transmembrane proteinCytoplasmAntibodyEpitopeVirologyHuman immunodeficiency virus (HIV)DNA vaccinationImmunologyMedicineBiologyCell biologyGeneticsImmunizationReceptor

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The HIV-1 gp41 MPER contains the epitopes for 4 broadly neutralizing (bNt) antibodies (Abs), making it a target for vaccine design. We developed a panel of DNA-vaccine candidates that link the MPER, or larger portions of gp41’s external domain, to two different transmembrane (TM) and cytoplasmic (CT) domains. We report on the ability of DNA vaccines expressing these constructs to elicit MPER-specific Nt Abs in rabbits. DNA vaccines encoding various gp41 ectodomain fragments, and the TM and CT of either the platelet-derived growth factor receptor (PGDFR-TM), or the TM and truncated CT of gp41 (TM1), were used to immunize rabbits; immune sera were tested for reactivity against the MPER displayed on the cell surface and for pseudovirus neutralization. Immunizations with plasmids expressing larger fragments of the gp41 ectodomain tethered to the PDGFR-TM elicited lower-titer Abs against the MPER, as compared to the MPER tethered to the PDGFR-TM, which elicited MPER-specific Abs that included those targeting the 2F5 epitope Affinity purification of these Abs on 2F5-epitope peptide resulted in Abs that bound MPER expressed on cells, but neutralized both pseudoviruses bearing HIV envelope and those bearing AMLV envelope. Immunization with DNA vaccines encoding the MPER fused to the gp41 TM1, elicited low-titre Abs that cross-reacted weakly with the MPER and strongly with regions in the CT. All immunization failed to produce Abs that cross-react with the 4E10 epitope. While the initial immunization studies reported here demonstrate that MPER reactivity is elicited by DNA immunization, the MPER-TM1 construct appears to elicit Abs against epitopes in its 27-aa CT domain. Current work is focused on replacing the gp41 TM with an engineered TM that will optimally expose the epitopes for the bNt MAbs, particularly 4E10.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,220
Score d'incertitude au seuil0,547

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,016
Tête enseignante GPT0,244
Écart entre enseignants0,227 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2012
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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