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Enregistrement W2065502111 · doi:10.1074/jbc.m300604200

Mechanisms for the Formation of Isoprostane Endoperoxides from Arachidonic Acid

2003· article· en· W2065502111 sur OpenAlexaboutno aff
Huiyong Yin, Christine M. Havrilla, Ling Gao, Jason D. Morrow, Ned A. Porter

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2003
Typearticle
Langueen
DomaineChemistry
ThématiqueFree Radicals and Antioxidants
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesDivision of ChemistryNational Institute of Environmental Health SciencesNational Institute of General Medical SciencesNational Heart, Lung, and Blood InstituteNational Science FoundationNational Institutes of HealthVanderbilt University
Mots-clésAutoxidationChemistryIsoprostanesArachidonic acidIsoprostaneDioxetaneFragmentation (computing)StereochemistryOxidative stressOrganic chemistryBiochemistryLipid peroxidationChemiluminescenceEnzyme

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The isoprostanes are a class of autoxidation products generated from arachidonic acid (or its esters) by a free radical initiated process. The potent biological activity of these compounds has been attracting intense research interest since they were detected in humans as well as animal models in the early 1990s. The measurement of these compounds has been regarded as one of the most useful non-invasive biomarkers for oxidative stress status. Two mechanisms for the formation of these compounds have been proposed. In the first mechanism, a peroxyl radical undergoes successive 5-exo cyclizations analogous to the enzymatic mechanism proposed for prostaglandin biosynthesis. The second mechanism starts with a 4-exo cyclization of a peroxyl radical leading to an intermediate dioxetane, a mechanism that has also been proposed for prostaglandin biosynthesis as well as for the formation of 4-hydroxy nonenal (HNE). Autoxidation of cholesteryl-15-HpETE under free radical conditions provides Type IV isoprostanes. The "dioxetane" mechanism for isoprostane generation from 15-HpETE requires that optically pure products are formed from an optically pure reactant, whereas an alternate mechanism for the process involving beta-fragmentation of the 15-peroxyl would give racemic isoprostane products. We have carried out a test of the mechanism based upon these stereochemical requirements. The results of analysis of the product mixture derived from autoxidation of optically pure Ch-15-HpETE by atmospheric pressure chemical ionization-mass spectrometry coupled with chiral high performance liquid chromatography indicate that the major isoprostane diastereomers are formed as a racemic mixture. These experimental results are consistent with a mechanism for isoprostane formation involving beta-fragmentation of the 15-peroxyl radical followed by re-addition of oxygen to form the 11-HPETE peroxyl, and they exclude a mechanism proceeding through the formation of a dioxetane intermediate.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,001
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,027
Tête enseignante GPT0,237
Écart entre enseignants0,210 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations59
Publié2003
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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