Expression, purification, crystallization and preliminary crystallographic analysis of PilA from the nontypeable<i>Haemophilus influenzae</i>type IV pilus
Notice bibliographique
Résumé
The type IV pili of nontypeable Haemophilus influenzae (NTHi) are involved in twitching motility, adherence, competence and biofilm formation. They are potential virulence factors for this important human pathogen and are thus considered to be vaccine targets. To characterize these pili, an attempt to solve the atomic structure of the major pilin subunit PilA was initiated. A 1.73 Å resolution X-ray diffraction data set was collected from native N-terminally truncated PilA (ΔN-PilA). Data processing indicated a hexagonal crystal system, which was determined to belong to space group P6(1) or P6(5) based on the systematic absences and near-perfect twinning of the crystal. The unit-cell parameters were a = b = 68.08, c = 197.03 Å with four molecules in the asymmetric unit, giving a solvent content of 50%. Attempts to solve the ΔN-PilA structure by molecular replacement with existing type IV pilin and type II secretion pseudopilin structures are in progress.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».