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Enregistrement W2066488419 · doi:10.1002/pro.649

Structural and enzymatic characterization of NanS (YjhS), a 9‐<i>O</i>‐Acetyl <i>N</i>‐acetylneuraminic acid esterase from <i>Escherichia coli O157:H7</i>

2011· article· en· W2066488419 sur OpenAlex
Erumbi S. Rangarajan, Karen M. Ruane, Ariane Proteau, Joseph D. Schrag, Ricardo Valladares, Claudio F. González, Michel Gilbert, Alexander F. Yakunin, Mirosław Cygler

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueProtein Science · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGlycosylation and Glycoproteins Research
Établissements canadiensUniversity of TorontoNational Research Council CanadaBiotechnology Research InstituteInstitute for Biological SciencesMcGill University
Organismes subventionnairesBasic Energy SciencesNational Research Council CanadaNational Center for Research ResourcesWestern Economic Diversification CanadaBiological and Environmental ResearchNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaBrookhaven National LaboratoryCanadian Institutes of Health ResearchNational Institutes of HealthCanadian Light SourceU.S. Department of Energy
Mots-clésEsteraseSialic acidEnzymeBiochemistryChemistryNeuraminidaseHydrolaseEscherichia coliStereochemistryBiologyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

There is a high prevalence of sialic acid in a number of different organisms, resulting in there being a myriad of different enzymes that can exploit it as a fermentable carbon source. One such enzyme is NanS, a carbohydrate esterase that we show here deacetylates the 9 position of 9-O-sialic acid so that it can be readily transported into the cell for catabolism. Through structural studies, we show that NanS adopts a SGNH hydrolase fold. Although the backbone of the structure is similar to previously characterized family members, sequence comparisons indicate that this family can be further subdivided into two subfamilies with somewhat different fingerprints. NanS is the founding member of group II. Its catalytic center contains Ser19 and His301 but no Asp/Glu is present to form the classical catalytic triad. The contribution of Ser19 and His301 to catalysis was confirmed by mutagenesis. In addition to structural characterization, we have mapped the specificity of NanS using a battery of substrates.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,018
Score d'incertitude au seuil0,648

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,253
Écart entre enseignants0,231 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle