Activity of Lambda-Exonuclease on Surface-Attached Oligonucleotide Detected by Acoustic Wave Device and Radiochemical Labeling
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Single-strand 25-mer oligonucleotides have been attached to the surface of a 9-MHz acoustic wave sensor incorporated into a flow-through configuration. This was achieved by an online interaction of the biotinylated probe with chemisorbed neutravidin. Duplex formation with complementary 25-mer was monitored by acoustic wave detection in real time. Regeneration of the probe-modified surface was achieved using online introduction of λ-exonuclease, an enzyme that digests a single strand of double-stranded DNA beginning with the 5′ end, cleaving single nucleotides as it progresses. Thus, with the 5′ end of the probe strand remaining inaccessible because of the biotin-neutravidin linkage, the target strand was successfully removed by enzymatic digestion. The results of the acoustic wave work are correlated with analogous experiments involving oligonucleotides labeled with 32P. Keywords: Acoustic wave devicebiosensors λ-exonucleaseflow-through formatnucleic acid 32P labelingsensor regeneration The authors are grateful to the Natural Sciences and Engineering Research Council of Canada for support of this work. Also, we thank Jon Ellis of the Institute of Biomaterials and Biomedical Engineering of the University of Toronto for very helpful discussions regarding the physics of acoustic wave propagation and assistance in the preparation of the manuscript. Notes Note. Additions of labeled F2 are given in bold type. a Labeled F2 is designated F2∗. Conditions are A: F2 (39 pmol), exo (90 min); B: F2 (735 pmol), exo (90 min); C: F2 (750 pmol), exo (15 min); D: F2 (1490 pmol), exo (15) min.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».