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Enregistrement W2066760760 · doi:10.1021/bi4001326

Modification of a Designed Amphipathic Cell-Penetrating Peptide and Its Effect on Solubility, Secondary Structure, and Uptake Efficiency

2013· article· en· W2066760760 sur OpenAlexaff
Mousa Jafari, D. Nedra Karunaratne, Chad M. Sweeting, P. Chen

Notice bibliographique

RevueBiochemistry · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA Interference and Gene Delivery
Établissements canadiensUniversity of Waterloo
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPeptideAmphiphileSolubilityChemistryChinese hamster ovary cellBiophysicsCytotoxicityCell-penetrating peptideProtein secondary structureMembraneCombinatorial chemistryPeptide sequenceAqueous solutionBiochemistryIn vitroOrganic chemistryBiologyGenePolymer

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The development of safe and efficient nonviral gene delivery carriers has received a great deal of attention in the past decade. A class of amphipathic peptides has shown to be able to cross cell membranes and deliver cargo to the intracellular environment. Here, we introduce an 18-mer amphipathic peptide, C6M1, as a modified version of peptide C6 for short interfering RNA (siRNA) delivery. The importance of tryptophan residues and the effect of peptide sequence modification on its solubility, secondary structure, cytotoxicity, and uptake efficiency were investigated. The solubility of C6M1 in aqueous solutions was greatly enhanced compared to that of C6, confirmed by surface tension and anilinonaphthalene-8-sulfonic acid fluorescence measurements. C6M1 had a random/helical structure in water with the ability to attain a helical conformation in the presence of anionic components or membrane-mimicking environments. The modification significantly reduced the cytotoxicity of the peptide, making it a safer carrier for siRNA delivery. C6M1 was also found ∼90% more efficient than C6 in delivering Cy3-labeled siRNA in Chinese hamster ovary cells.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,009
Score d'incertitude au seuil0,634

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,237
Écart entre enseignants0,226 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations31
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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