Intestinal Dysbiosis and Potential Consequences of Microbiome-altering Antibiotic Use in the Pathogenesis of Human Rheumatic Disease
Notice bibliographique
Résumé
The etiopathogenesis of chronic, rheumatic autoimmune disorders has been the focus of intense research since their initial literary description.Despite much scientific iteration, the current hypothesis postulates that the natural history of most such diseases is complex and multifactorial.Ultimately, it is thought that both genetic factors (including epigenetic) and environmental influences determine the fate of predisposed subjects, who then develop clinically evident disease.The modern notion that autoimmune arthritides are the result of polygenic interactions dates back to the mid-1970s when it was shown that HLA-B27 conferred a high risk for classic ankylosing spondylitis (AS) 1 , followed by the description of the shared epitope hypothesis in 1987, which posited that HLA class II alleles, particularly DR-β1, conferred higher risk for the development of rheumatoid arthritis (RA) 2 .This, along with the advent of the Human Genome Project and the upsurge of genome-wide association studies, had led to an overly optimistic and, arguably, reductionist understanding of the etiology of inflammatory arthropathies.The last 3 decades have seen an ever-expanding use of high-throughput DNA sequencing by multiple groups in a quest to ascribe risk-alleles to the various autoimmune and rheumatic syndromes.This effort has resulted in, among other advances, the identification of many HLA and non-HLA risk alleles associated with disease and the emergence of a functional genomics approach to discovery and validation of immune pathways and molecular mechanisms implicated in the pathogenesis of these disorders 3,4 .Although the influence of heritability for many of these arthritides is considerable, current genetic discoveries can only explain up to 20% of the variance in RA and in juvenile idiopathic arthritis (JIA) 3,4 .These include many HLA alleles (particularly HLA-A2, HLA-DR5, and HLA-DR8), and a handful of non-HLA loci (i.e., PTPN22, MI, SLC11A6, and WISP3).Importantly, mendelian patterns of inheritance
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,005 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,007 | 0,005 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».