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Enregistrement W2067142462 · doi:10.1046/j.1537-2995.2002.00112.x

Acute nosocomial HCV infection detected by NAT of a regular blood donor

2002· article· en· W2067142462 sur OpenAlexaffabout
Bryce Larke, Yu‐Wen Hu, Mel Krajden, Vito Scalia, Sean K. Byrne, Lesia R. Boychuk, Judith Klein

Notice bibliographique

RevueTransfusion · 2002
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueHepatitis C virus research
Établissements canadiensCanadian Blood ServicesBC Centre for Disease ControlUniversity of AlbertaCapital District Health Authority
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMedicineBlood donorHepatitis C virusHepatitis CViral quasispeciesHepacivirusNatAntibioticsHypervariable regionVirologyVirusImmunologyAntibodyBiologyMicrobiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Routine HCV NAT of blood donors to detect persons in the preseroconversion phase of acute infection was introduced in Canada in October 1999. The source of virus exposure was investigated in the first, and to date only, blood donor found to be HCV NAT positive, anti-HCV negative in Canada. He was a regular donor with none of the commonly reported risk factors for HCV infection. STUDY DESIGN AND METHODS: Epidemiologic follow-up revealed that the blood donor had received antibiotics at an outpatient IV clinic 5 weeks before donation. IV solution bags and tubing for individual patients were stored in the clinic, and then the same equipment was used each time the patient returned for the next dose of antibiotics until it was replaced after every 72-hour period. Among eight other patients whose clinic visitation times overlapped was a man with chronic HCV infection. Genomic sequencing of HCV isolates from the blood donor, the patient with chronic hepatitis C, and local controls was carried out to study possible nosocomial infection. RESULTS: Genomic sequencing showed a high degree of relatedness in the hypervariable region of HCV isolates from the blood donor and putative source patient as compared with controls. Detailed molecular analysis of quasispecies of the HCV isolates further indicated that viruses from the two individuals were genetically very close to each other. CONCLUSION: The introduction of routine screening of blood donors by HCV NAT was directly responsible for the early detection and investigation of an unusual case of HCV infection involving a regular donor. Genomic sequencing studies provided firm evidence of patient-to-patient transmission of HCV in an IV clinic. The report clearly demonstrates the value of molecular fingerprinting in tracking nosocomial HCV infections.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesCharge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,055
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,019
Tête enseignante GPT0,275
Écart entre enseignants0,256 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations15
Publié2002
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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