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Enregistrement W2067223679 · doi:10.1093/oxfordjournals.rpd.a006739

Monte Carlo Simulations of DNA Damage from Incorporated Cold Iodine Following Photoelectrically Induced Auger Electron Cascades

2002· article· en· W2067223679 sur OpenAlexaff
Vitali Moiseenko, S Karnas, Edward Yu, Jerry Battista

Notice bibliographique

RevueRadiation Protection Dosimetry · 2002
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAdvanced biosensing and bioanalysis techniques
Établissements canadiensWestern University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMonte Carlo methodPhysicsAugerNucleosomeAuger effectElectronAtomic physicsIrradiationDNA damageAuger electron spectroscopyRadiation damageMolecular physicsDNABiophysicsChemistryHistoneNuclear physicsBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Radiation-induced damage in nucleosomal DNA from Auger electron cascades due to incorporated cold IUdR has been modelled through Monte Carlo simulations. Probabilities of DNA double strand break (DSB) production following a vacancy in the K, L, M and N shells of iodine are estimated. DSB complexity from the base damage accompanying a break was also estimated. Multiple DSB events were analysed for correlated breaks due to nucleosome periodicity. The probability of an Auger cascade causing at least one DSB strongly depended on the shell in which the initial vacancy was produced. This probability was approximately 0.35 for K and L shells and fell to 0.02 for the N shell. As expected, DSBs were predominantly induced in a nucleosome containing incorporated iodine and were accompanied with extensive base damage. Analysis of multiple DSB events showed that approximately 14% of the DSBs produced following a vacancy in the L1 orbital can be interpreted as correlated with base pair separation attributable to the nucleosome periodicity. The data generated in this work provide a basis for the development of photon-activation therapy using kilovoltage X rays incident upon IUdR sensitised tumours.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: Simulation ou modélisation
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,025
Score d'incertitude au seuil0,049

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0020,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,253
Écart entre enseignants0,238 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations10
Publié2002
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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